More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3404 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.91 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  63.98 
 
 		 625 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  60.45 
 
 		 596 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  76.22 
 
 		 605 aa  894    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.91 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  62.63 
 
 		 620 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  59.42 
 
 		 596 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  65.87 
 
 		 599 aa  781    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  61.17 
 
 		 572 aa  691    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  61.24 
 
 		 669 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.24 
 
 		 669 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.91 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.91 
 
 		 669 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  64.42 
 
 		 604 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  62.96 
 
 		 620 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  64.75 
 
 		 595 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  60.74 
 
 		 663 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  62.96 
 
 		 620 aa  742    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  63.32 
 
 		 626 aa  724    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  64.82 
 
 		 581 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  62.63 
 
 		 620 aa  743    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  78.17 
 
 		 600 aa  958    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  61.24 
 
 		 669 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  64.04 
 
 		 625 aa  738    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.61 
 
 		 603 aa  745    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  100 
 
 		 600 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  62.29 
 
 		 622 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  63.42 
 
 		 599 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  63.56 
 
 		 595 aa  718    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  62.63 
 
 		 620 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  62.71 
 
 		 601 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  64.75 
 
 		 595 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  62.79 
 
 		 620 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  56.91 
 
 		 630 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  50.61 
 
 		 598 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  50.18 
 
 		 596 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  50.17 
 
 		 585 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  48.94 
 
 		 593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  43.25 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.1 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.66 
 
 		 621 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.58 
 
 		 598 aa  343  4e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  36.87 
 
 		 663 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 		 621 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  37.85 
 
 		 609 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  36.7 
 
 		 636 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  37.37 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  37.54 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.78 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.33 
 
 		 637 aa  337  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  37.2 
 
 		 637 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  37.97 
 
 		 643 aa  335  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.48 
 
 		 623 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  37.46 
 
 		 630 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  38.67 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  35.88 
 
 		 567 aa  324  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  34.43 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.44 
 
 		 629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  36.44 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  36.93 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  34.58 
 
 		 587 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  36.18 
 
 		 587 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1120  ABC transporter, transmembrane region  37.11 
 
 		 617 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0902217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  33.95 
 
 		 603 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.38 
 
 		 624 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  35.48 
 
 		 633 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.14 
 
 		 612 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  40.04 
 
 		 618 aa  300  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  33.95 
 
 		 603 aa  299  9e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  38.09 
 
 		 621 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  36.19 
 
 		 612 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  33.28 
 
 		 610 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1912  ABC transporter related  36.1 
 
 		 604 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  36.94 
 
 		 626 aa  297  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.05 
 
 		 614 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  34.43 
 
 		 587 aa  296  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  38.75 
 
 		 614 aa  296  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  33.28 
 
 		 610 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  36.88 
 
 		 614 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  37.22 
 
 		 624 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  35.98 
 
 		 591 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  40.69 
 
 		 627 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.98 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.98 
 
 		 578 aa  294  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  37.97 
 
 		 599 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  36.88 
 
 		 611 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  36.67 
 
 		 587 aa  293  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  35.11 
 
 		 612 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  35.11 
 
 		 612 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  38.45 
 
 		 638 aa  292  9e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  36.22 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.56 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2185  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.7 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.56 
 
 		 623 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  39.28 
 
 		 606 aa  291  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>