More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7111 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  59.66 
 
 		 595 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1206    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  66.5 
 
 		 669 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.68 
 
 		 603 aa  763    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  60.65 
 
 		 599 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  59.2 
 
 		 581 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  66.5 
 
 		 669 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  68.61 
 
 		 626 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  60.48 
 
 		 595 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  67.28 
 
 		 620 aa  830    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  59.73 
 
 		 599 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  66.83 
 
 		 669 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  64.48 
 
 		 572 aa  757    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  65.5 
 
 		 604 aa  806    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  59.11 
 
 		 595 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  67.28 
 
 		 620 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  67.11 
 
 		 601 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  66.17 
 
 		 663 aa  762    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  67.61 
 
 		 620 aa  829    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  61.23 
 
 		 600 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  67.28 
 
 		 620 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  70.78 
 
 		 625 aa  852    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.5 
 
 		 669 aa  750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  60.45 
 
 		 600 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  59.66 
 
 		 605 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.67 
 
 		 669 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  66.83 
 
 		 669 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  67.28 
 
 		 620 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  90.94 
 
 		 596 aa  1085    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  66.39 
 
 		 622 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  70.62 
 
 		 625 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  67.61 
 
 		 620 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.5 
 
 		 669 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  53.65 
 
 		 630 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  47.78 
 
 		 598 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  49.22 
 
 		 596 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  50 
 
 		 585 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  45.65 
 
 		 593 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  40.72 
 
 		 591 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.05 
 
 		 595 aa  350  5e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2203  ABC transporter related  37.43 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  36.94 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.78 
 
 		 598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.13 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  36.43 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  36.13 
 
 		 623 aa  330  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1768  ABC transporter related  35.47 
 
 		 622 aa  329  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.09 
 
 		 637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  35.8 
 
 		 643 aa  326  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  36.58 
 
 		 597 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  35.19 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  35.19 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  35.19 
 
 		 663 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  35.02 
 
 		 636 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.56 
 
 		 589 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  35.73 
 
 		 609 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  35.02 
 
 		 637 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  41.36 
 
 		 624 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  35.84 
 
 		 630 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  36.16 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1542  ABC transporter related  39.63 
 
 		 621 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264596  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  32.73 
 
 		 597 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7080  ABC transporter related  41.67 
 
 		 621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.161763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  35.9 
 
 		 587 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  36.35 
 
 		 612 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  32.48 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  33.28 
 
 		 633 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.35 
 
 		 612 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5775  ABC transporter related  38.89 
 
 		 617 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.832359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6140  ABC transporter related  38.89 
 
 		 617 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.660679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  36.64 
 
 		 626 aa  310  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  38.57 
 
 		 614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  33.91 
 
 		 587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  33.9 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  34.72 
 
 		 587 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6620  ABC transporter related  38.48 
 
 		 617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.349027  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  42.03 
 
 		 593 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  36.96 
 
 		 637 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  32.14 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  35.8 
 
 		 622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  38.28 
 
 		 611 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  35.7 
 
 		 590 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  36.67 
 
 		 623 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  36.67 
 
 		 623 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2892  ABC transporter related  38.37 
 
 		 612 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  35.17 
 
 		 612 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7674  ABC efflux pump, ATPase subunit  37.75 
 
 		 617 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22456  normal  0.131905 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  43.13 
 
 		 599 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  43.81 
 
 		 593 aa  303  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  34.72 
 
 		 591 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  35.78 
 
 		 624 aa  303  7.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  37.16 
 
 		 623 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  35.6 
 
 		 624 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  36.27 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>