More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1637 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4941  ABC transporter related  56.48 
 
 
604 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.690923  normal  0.361162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3797  ABC transporter related  57.82 
 
 
620 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  normal  0.145878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0276  ABC transporter related  55.46 
 
 
601 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3727  ABC transporter related  57.82 
 
 
620 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal  0.56235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2299  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  57.48 
 
 
620 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2182  ABC transporter related  56.95 
 
 
600 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3404  ABC transporter related  56.91 
 
 
600 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00337035  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4939  ABC transporter related  57.53 
 
 
626 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.777528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3687  ABC transporter related  57.14 
 
 
620 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4566  ABC transporter related  57.82 
 
 
620 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1637  ABC transporter related  100 
 
 
630 aa  1245    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135005  normal  0.475393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5523  ABC transporter related  57.31 
 
 
620 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2875  ABC transporter related  57.29 
 
 
625 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216771  normal  0.111784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1248  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  56 
 
 
625 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  60.91 
 
 
572 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6143  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.35 
 
 
603 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0712  ABC transporter related  54.49 
 
 
596 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0247864  normal  0.335635 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7111  ABC transporter related  54.32 
 
 
596 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483113  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2811  ABC transporter related  58.81 
 
 
595 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.882155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  58.88 
 
 
581 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3233  ABC transporter related  55.46 
 
 
599 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494492  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6186  multidrug ABC transporter ATPase/permease  54.9 
 
 
605 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159052  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4845  ABC transporter related  54.3 
 
 
599 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  56.81 
 
 
669 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2524  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.64 
 
 
669 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3039  ABC transporter related  58.47 
 
 
595 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2665  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  56.81 
 
 
669 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0515  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  56.72 
 
 
663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  56.81 
 
 
622 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0233  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  56.31 
 
 
669 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  58.47 
 
 
595 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1612  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  56.31 
 
 
669 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658136  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0270  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.31 
 
 
669 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1416  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.31 
 
 
669 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  49.92 
 
 
598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4093  ABC transporter related  49.83 
 
 
585 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0356  ABC transporter related  46.78 
 
 
596 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  45.98 
 
 
593 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5858  ABC transporter related  38.14 
 
 
591 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.21 
 
 
595 aa  333  6e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  41.37 
 
 
597 aa  327  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.23 
 
 
598 aa  322  9.000000000000001e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  41.13 
 
 
630 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  37.16 
 
 
652 aa  310  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  34.95 
 
 
655 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  37.19 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  38.59 
 
 
606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  36.85 
 
 
643 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0689  ABC transporter related  36.6 
 
 
644 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366434  normal  0.23371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1494  ABC transporter related  36.77 
 
 
647 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  38.43 
 
 
622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  33.76 
 
 
661 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3504  multidrug ABC transporter ATPase/permease  35.99 
 
 
657 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  37.92 
 
 
628 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  39.27 
 
 
608 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  37.09 
 
 
640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 
592 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5281  ABC transporter related  37.61 
 
 
655 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  34.28 
 
 
626 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1909  ABC transporter related  39.71 
 
 
672 aa  302  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
589 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  36.55 
 
 
599 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  35.69 
 
 
612 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.35 
 
 
624 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.69 
 
 
612 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  38.81 
 
 
606 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  39.42 
 
 
609 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  36.79 
 
 
991 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  38.29 
 
 
587 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  36.79 
 
 
981 aa  302  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  35.75 
 
 
652 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.34 
 
 
621 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0449  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.35 
 
 
625 aa  301  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  34.69 
 
 
612 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0442  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.35 
 
 
628 aa  301  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  39 
 
 
663 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2074  ABC transporter related  35.65 
 
 
651 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  34.47 
 
 
612 aa  300  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  34.51 
 
 
597 aa  299  9e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  36.94 
 
 
638 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.51 
 
 
621 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  38.8 
 
 
636 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4185  ABC transporter related  38.89 
 
 
654 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  36.36 
 
 
593 aa  298  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.3 
 
 
637 aa  298  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  35.21 
 
 
651 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2616  ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 
591 aa  297  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.6 
 
 
628 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.55 
 
 
610 aa  296  7e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
603 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  39.44 
 
 
606 aa  296  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.55 
 
 
610 aa  296  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  36.83 
 
 
633 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  38.72 
 
 
637 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>