More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1142 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1041  ABC transporter related  59.14 
 
 		 663 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645663 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2840  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1764  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2753  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2813  putative ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0327  ABC transporter, transmembrane region  75.64 
 
 		 587 aa  897    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2871  ABC transporter ATP binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  63.01 
 
 		 588 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2782  putative fused ATP-binding/permease protein  77.87 
 
 		 587 aa  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.896144  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1159  ABC transporter related  59.14 
 
 		 637 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4271  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  58.62 
 
 		 637 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  63.79 
 
 		 589 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1756  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3210  ABC transporter related  80.24 
 
 		 587 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.461099  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  63.54 
 
 		 587 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1243  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and innermembrane subunits  57.63 
 
 		 623 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.806576  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1142  ABC transporter related  100 
 
 		 585 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0417  ABC transporter related  77.17 
 
 		 587 aa  934    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2441  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  57.93 
 
 		 621 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6620  ABC transporter related  63.71 
 
 		 587 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00971242  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  64.25 
 
 		 588 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0680  ABC transporter related  58.97 
 
 		 637 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1135  ABC transporter related  59.14 
 
 		 637 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2879  ABC transporter related  57.24 
 
 		 643 aa  661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2146  ABC transporter related  59.31 
 
 		 609 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31543  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  64.25 
 
 		 588 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0860  ABC transporter related  57.46 
 
 		 630 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1037  ABC transporter related  58.97 
 
 		 636 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0505  ABC transporter related  53.45 
 
 		 599 aa  626  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.555752  normal  0.0162787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0567  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  58.64 
 
 		 589 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  52.82 
 
 		 611 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1362  ABC transporter related  54.66 
 
 		 617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  54.86 
 
 		 611 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  47.55 
 
 		 591 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  45.94 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  44.09 
 
 		 587 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0085  ABC transporter related  45.23 
 
 		 604 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2163  hypothetical protein  34.56 
 
 		 610 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2190  hypothetical protein  34.75 
 
 		 610 aa  365  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  34.56 
 
 		 603 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  34.09 
 
 		 603 aa  359  9e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  34.68 
 
 		 633 aa  343  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0054  hypothetical protein  33.5 
 
 		 597 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2928  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  40.17 
 
 		 617 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3071  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.53 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0688673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  40.41 
 
 		 619 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0067  hypothetical protein  35.66 
 
 		 599 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3213  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.45 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1585  hypothetical protein  33.98 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  36.76 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  34.49 
 
 		 638 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2169  ABC transporter related  40.41 
 
 		 617 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  38.25 
 
 		 609 aa  316  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  36.49 
 
 		 618 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2131  ABC transporter related  39.46 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  38.85 
 
 		 613 aa  312  9e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.4 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0860  ABC transporter related  38.62 
 
 		 621 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000519067  hitchhiker  0.000174676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1441  ABC transporter related  38.81 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1408  hypothetical protein  34.66 
 
 		 594 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0462  ABC transporter related  40.29 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2628  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 658 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1451  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 		 609 aa  309  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.296009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  35.61 
 
 		 598 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3203  ABC transporter related  38.84 
 
 		 617 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  35.87 
 
 		 613 aa  306  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  32.8 
 
 		 582 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1742  ABC transporter related  38.59 
 
 		 609 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.394506 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2821  ABC transporter related  37.5 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2782  ABC transporter related  37.88 
 
 		 618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0644  ABC transporter related  39.47 
 
 		 646 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.601366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1457  ABC transporter related  38.59 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.162011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3490  ATPase  36.29 
 
 		 614 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1621  ABC transporter related  38.81 
 
 		 618 aa  303  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0907741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2240  ABC transporter related  35.09 
 
 		 626 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2498  ABC transporter related  37.08 
 
 		 609 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.896627  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  34.92 
 
 		 607 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  39.26 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_002978  WD0616  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  32.94 
 
 		 591 aa  301  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.146496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  39.92 
 
 		 618 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2532  ABC transporter related  36.29 
 
 		 609 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00690658  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  31.81 
 
 		 582 aa  301  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1204  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.59 
 
 		 614 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494984  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.5 
 
 		 609 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1543  ABC transporter related  35.76 
 
 		 617 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  37.5 
 
 		 609 aa  300  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  37.5 
 
 		 609 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1419  ABC transporter related  37.5 
 
 		 609 aa  299  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00302849  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2865  ABC transporter related  40.04 
 
 		 614 aa  299  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.148905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  36.63 
 
 		 609 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1556  ABC transporter related  37.29 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00693987  normal  0.0222029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  36.26 
 
 		 610 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001027  ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3044  ABC transporter related  37.73 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.989361  normal  0.444628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2780  ABC transporter related  37.73 
 
 		 637 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  37.53 
 
 		 619 aa  297  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2173  ABC transporter related  38.6 
 
 		 616 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  36.68 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1494  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.54 
 
 		 630 aa  296  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.283216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>