More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2942 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 605 aa  1206    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3561  ABC transporter, transmembrane region  48.95 
 
 		 579 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  43.35 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.06 
 
 		 577 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.52 
 
 		 585 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  39.39 
 
 		 618 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  41.45 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  41.48 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.49 
 
 		 602 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 571 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.65 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4538  ABC transporter related  42.1 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.19 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  40.64 
 
 		 611 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  45.08 
 
 		 586 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  40.14 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  40.14 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.47 
 
 		 611 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.34 
 
 		 609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 		 596 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  44.13 
 
 		 579 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  41.2 
 
 		 601 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  40.77 
 
 		 624 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  37.63 
 
 		 609 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.23 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  37.72 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  41.9 
 
 		 588 aa  402  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.61 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2874  ABC transporter related  44.19 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2996  ABC transporter related  44.19 
 
 		 596 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.637483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  44.46 
 
 		 605 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  39.02 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3100  ABC transporter related  44.19 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.87066  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  40.86 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  38.24 
 
 		 601 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.33 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.14 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.86 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  38.16 
 
 		 600 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.66 
 
 		 579 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  38.1 
 
 		 600 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  38.31 
 
 		 600 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.14 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.82 
 
 		 601 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.25 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.61 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.15 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 		 582 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.9 
 
 		 582 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  37.92 
 
 		 600 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  35.1 
 
 		 572 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.59 
 
 		 579 aa  364  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.23 
 
 		 582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.23 
 
 		 582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.23 
 
 		 582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3027  ABC transporter related  41.25 
 
 		 572 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344484  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.04 
 
 		 574 aa  362  1e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  36.86 
 
 		 602 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.8 
 
 		 582 aa  360  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4230  ABC transporter related  38.29 
 
 		 621 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1292  ABC transporter related  37.28 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.23 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.89 
 
 		 590 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.5 
 
 		 601 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2763  transport ATP-binding protein msbA  38.79 
 
 		 590 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.714351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.58 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.14 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 581 aa  355  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.87 
 
 		 597 aa  354  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.48 
 
 		 592 aa  353  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.02 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  34.07 
 
 		 602 aa  351  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.68 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.95 
 
 		 582 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  37.39 
 
 		 579 aa  349  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.96 
 
 		 583 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.08 
 
 		 597 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.64 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.3 
 
 		 582 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.99 
 
 		 597 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0735  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.99 
 
 		 582 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.68 
 
 		 594 aa  347  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.29 
 
 		 600 aa  347  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>