More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0676 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  91.2 
 
 
587 aa  986    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  78 
 
 
594 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  100 
 
 
594 aa  1145    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  78.39 
 
 
590 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.17 
 
 
594 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  91.08 
 
 
588 aa  989    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  91.08 
 
 
588 aa  989    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  78.17 
 
 
594 aa  778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.93 
 
 
574 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  54.09 
 
 
569 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 
574 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  37.74 
 
 
575 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  36.64 
 
 
596 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.66 
 
 
581 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
571 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.72 
 
 
581 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
579 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.72 
 
 
577 aa  237  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
578 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.81 
 
 
577 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.76 
 
 
582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.72 
 
 
601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.95 
 
 
600 aa  210  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  35.59 
 
 
584 aa  210  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.67 
 
 
1228 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  31.78 
 
 
606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  32.05 
 
 
582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.18 
 
 
576 aa  196  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  30.53 
 
 
595 aa  194  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.23 
 
 
607 aa  193  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.25 
 
 
627 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  31.44 
 
 
596 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.33 
 
 
581 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
579 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.42 
 
 
614 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.21 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.64 
 
 
598 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  31.05 
 
 
599 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  26.45 
 
 
602 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  29.76 
 
 
593 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  38.26 
 
 
595 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.48 
 
 
592 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.7 
 
 
579 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.72 
 
 
619 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  28.52 
 
 
587 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  30.26 
 
 
592 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
1218 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.37 
 
 
574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.15 
 
 
574 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.73 
 
 
583 aa  180  5.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.96 
 
 
572 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  31.25 
 
 
574 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
578 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  30.8 
 
 
610 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.09 
 
 
579 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  31.98 
 
 
565 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  28.77 
 
 
609 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.98 
 
 
1257 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  30.62 
 
 
610 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  30.62 
 
 
610 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  32.42 
 
 
606 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40 
 
 
580 aa  176  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
606 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.16 
 
 
627 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.38 
 
 
666 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.36 
 
 
579 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  29.56 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  32.58 
 
 
597 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  27.27 
 
 
590 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  29.11 
 
 
579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.95 
 
 
572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  37.39 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2631  ABC transporter related  34.48 
 
 
608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478405  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.42 
 
 
614 aa  175  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.79 
 
 
610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.35 
 
 
573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  28.94 
 
 
588 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  36.1 
 
 
624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.11 
 
 
1436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  29.41 
 
 
655 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  26.7 
 
 
581 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.73 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3016  ABC transporter related  34.84 
 
 
605 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.520064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2942  ABC transporter, transmembrane region  34.7 
 
 
605 aa  174  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.51 
 
 
598 aa  174  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  27.69 
 
 
604 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  33.88 
 
 
626 aa  174  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  30.69 
 
 
605 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.13 
 
 
627 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
588 aa  173  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.45 
 
 
590 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.46 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.17 
 
 
628 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  24.17 
 
 
587 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  32.1 
 
 
612 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.53 
 
 
593 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.47 
 
 
580 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  24.17 
 
 
587 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 
596 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.19 
 
 
622 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>