More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0534 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  49.65 
 
 		 739 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  52.23 
 
 		 734 aa  756    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  100 
 
 		 727 aa  1474    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  53.55 
 
 		 738 aa  768    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  52.09 
 
 		 734 aa  753    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  56.94 
 
 		 727 aa  852    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  40.5 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  40.31 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  40.92 
 
 		 760 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  39.42 
 
 		 747 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  38.09 
 
 		 721 aa  525  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  39.61 
 
 		 721 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  38.9 
 
 		 716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  39.53 
 
 		 716 aa  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  38 
 
 		 722 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.11 
 
 		 759 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  54.36 
 
 		 455 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  36.11 
 
 		 715 aa  463  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.83 
 
 		 1040 aa  459  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.47 
 
 		 1019 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 		 906 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  35.82 
 
 		 906 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.31 
 
 		 1038 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36 
 
 		 908 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 		 1038 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.92 
 
 		 1018 aa  435  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.69 
 
 		 1018 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.97 
 
 		 1018 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  33.75 
 
 		 1042 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  34.12 
 
 		 1011 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.33 
 
 		 1013 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  33.01 
 
 		 908 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.1 
 
 		 1024 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  52.17 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.6 
 
 		 1008 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.6 
 
 		 1008 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  31.67 
 
 		 725 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  31.58 
 
 		 722 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.73 
 
 		 1000 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.92 
 
 		 730 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  33.47 
 
 		 716 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  33.52 
 
 		 737 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  30.75 
 
 		 722 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.27 
 
 		 741 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  33.83 
 
 		 930 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  32.17 
 
 		 738 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  32.1 
 
 		 741 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  30.43 
 
 		 736 aa  362  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  34.24 
 
 		 980 aa  361  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.28 
 
 		 976 aa  360  7e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 728 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.4 
 
 		 726 aa  359  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.84 
 
 		 739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  33.04 
 
 		 700 aa  356  8.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.45 
 
 		 597 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  31.1 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  30.45 
 
 		 733 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  32.23 
 
 		 721 aa  356  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  31.84 
 
 		 715 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  31.91 
 
 		 720 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  31.44 
 
 		 724 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  31.44 
 
 		 724 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.86 
 
 		 971 aa  352  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.75 
 
 		 865 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  31.17 
 
 		 731 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 735 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.86 
 
 		 999 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.42 
 
 		 720 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.87 
 
 		 1003 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.22 
 
 		 556 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.75 
 
 		 1001 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.86 
 
 		 1013 aa  342  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  30.32 
 
 		 892 aa  342  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.4 
 
 		 726 aa  342  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  32.63 
 
 		 975 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.25 
 
 		 725 aa  340  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  31.21 
 
 		 731 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.26 
 
 		 699 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  30.09 
 
 		 723 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.96 
 
 		 1006 aa  338  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  30.09 
 
 		 723 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0904  ABC transporter related  31.54 
 
 		 1717 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.971104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.96 
 
 		 705 aa  336  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  29.27 
 
 		 719 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  32.16 
 
 		 701 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  32.86 
 
 		 706 aa  332  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  30.19 
 
 		 773 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  29.81 
 
 		 802 aa  330  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  30.75 
 
 		 743 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  30.43 
 
 		 720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  28.8 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  29.76 
 
 		 721 aa  328  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.88 
 
 		 721 aa  328  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.06 
 
 		 750 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.47 
 
 		 728 aa  327  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.3 
 
 		 725 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  30.96 
 
 		 968 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.14 
 
 		 734 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.94 
 
 		 743 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  30.69 
 
 		 712 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>