More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3060 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  100 
 
 		 576 aa  1177    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  31.71 
 
 		 551 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  33.6 
 
 		 546 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  31.84 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  33.13 
 
 		 567 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  30.41 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.35 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.53 
 
 		 543 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  29.73 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.53 
 
 		 543 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  30.33 
 
 		 552 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.25 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  30.95 
 
 		 581 aa  276  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  30.39 
 
 		 558 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  30.3 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  31.5 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  31.71 
 
 		 566 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.31 
 
 		 562 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  28.89 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  31.38 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.52 
 
 		 542 aa  264  4e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.7 
 
 		 581 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  29.72 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  28.52 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  29.17 
 
 		 607 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  29.17 
 
 		 607 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  29.17 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  31.36 
 
 		 548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  29.38 
 
 		 581 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  28.81 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  30.7 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.74 
 
 		 548 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.35 
 
 		 650 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.55 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.88 
 
 		 548 aa  252  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  30.64 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  28.35 
 
 		 550 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  31.3 
 
 		 1055 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.83 
 
 		 564 aa  246  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  26.99 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.87 
 
 		 557 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  28.74 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  29.83 
 
 		 597 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  29.94 
 
 		 563 aa  240  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.39 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.85 
 
 		 1032 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.76 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  28.54 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  28.81 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.76 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.76 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.76 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.76 
 
 		 547 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.1 
 
 		 547 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  29.61 
 
 		 558 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  230  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.79 
 
 		 547 aa  230  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28 
 
 		 547 aa  230  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  28.63 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  29.74 
 
 		 544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  30.75 
 
 		 555 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.82 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.91 
 
 		 550 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  28.69 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.57 
 
 		 564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  28.36 
 
 		 556 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.66 
 
 		 546 aa  213  7e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  28.16 
 
 		 556 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.32 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.92 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  30.28 
 
 		 554 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.81 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  27.62 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  26.77 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.41 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  23.56 
 
 		 568 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  23.08 
 
 		 588 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  21.73 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  21.93 
 
 		 555 aa  94  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  22.22 
 
 		 618 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40758  ATP-dependent permease  26.6 
 
 		 1197 aa  90.9  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00433632  normal  0.648895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.2 
 
 		 610 aa  90.5  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  21.42 
 
 		 597 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  20.04 
 
 		 583 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.63 
 
 		 590 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  27.23 
 
 		 571 aa  88.6  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  23.14 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>