More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2101 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  100 
 
 
541 aa  1087    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  34.01 
 
 
554 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  31.17 
 
 
549 aa  280  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.85 
 
 
1055 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  32.04 
 
 
544 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  29.67 
 
 
550 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.41 
 
 
650 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.31 
 
 
551 aa  236  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  30.68 
 
 
1032 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  31.84 
 
 
549 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  29.65 
 
 
567 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  230  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  28.24 
 
 
566 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  30.41 
 
 
547 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.41 
 
 
547 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  30.41 
 
 
547 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  28.9 
 
 
552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  29.26 
 
 
562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  27.43 
 
 
558 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  29.26 
 
 
546 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.43 
 
 
554 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.02 
 
 
543 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  29.35 
 
 
550 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.36 
 
 
543 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.36 
 
 
543 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.21 
 
 
564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.72 
 
 
547 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.4 
 
 
547 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.51 
 
 
547 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  31.91 
 
 
554 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.72 
 
 
547 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.72 
 
 
547 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.72 
 
 
547 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.54 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  28.12 
 
 
548 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.13 
 
 
548 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  30.89 
 
 
551 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.21 
 
 
542 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  31.79 
 
 
564 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  31.13 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  29.17 
 
 
552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.41 
 
 
557 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.05 
 
 
548 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  27.04 
 
 
553 aa  213  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  29.81 
 
 
558 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.62 
 
 
546 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  29.41 
 
 
558 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 
555 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  29.14 
 
 
579 aa  209  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  33.33 
 
 
551 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.71 
 
 
553 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.47 
 
 
557 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  28.83 
 
 
571 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  29.32 
 
 
576 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  28.74 
 
 
588 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.01 
 
 
544 aa  205  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.86 
 
 
562 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  30.06 
 
 
556 aa  203  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.8 
 
 
562 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  28.6 
 
 
556 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  28.01 
 
 
563 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 
562 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.72 
 
 
581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.16 
 
 
550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  28.97 
 
 
555 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  27.26 
 
 
581 aa  197  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  26.96 
 
 
557 aa  194  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  28.07 
 
 
560 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  27.05 
 
 
557 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  28.65 
 
 
581 aa  193  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  26.7 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  26.52 
 
 
581 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  27.82 
 
 
607 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  27.82 
 
 
607 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  27.82 
 
 
607 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  29.09 
 
 
597 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.76 
 
 
514 aa  171  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.31 
 
 
577 aa  107  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0225728  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  32.02 
 
 
727 aa  103  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.45 
 
 
573 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0349  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  22.87 
 
 
600 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730063  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.05 
 
 
573 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  28.78 
 
 
594 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.05 
 
 
573 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  31.05 
 
 
573 aa  100  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  31.05 
 
 
573 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  22.48 
 
 
605 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1806  transport ATP-binding protein CydD  23.93 
 
 
574 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1946  transport ATP-binding protein CydD  23.93 
 
 
574 aa  100  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>