More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1823 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  100 
 
 
555 aa  1132    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  66.1 
 
 
553 aa  715    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  47.77 
 
 
588 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  47.4 
 
 
562 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  47.32 
 
 
581 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  47.13 
 
 
607 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  47.32 
 
 
581 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  46.95 
 
 
581 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  47.13 
 
 
607 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  46.77 
 
 
581 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  47.13 
 
 
607 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 
562 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 
562 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  46.67 
 
 
581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  47 
 
 
560 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  45.78 
 
 
597 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  40.98 
 
 
546 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.88 
 
 
554 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.31 
 
 
564 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  37.31 
 
 
558 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  38.73 
 
 
552 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  37.43 
 
 
551 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  38.18 
 
 
550 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  37.5 
 
 
548 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  37.59 
 
 
564 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  38.13 
 
 
550 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  37.06 
 
 
552 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  36.05 
 
 
549 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  35.51 
 
 
563 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  36.19 
 
 
562 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  38.68 
 
 
554 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  38.12 
 
 
571 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.88 
 
 
564 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  35.29 
 
 
567 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  34.22 
 
 
551 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  34.35 
 
 
566 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  33.97 
 
 
1055 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  33.7 
 
 
552 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  35.21 
 
 
1032 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  31.84 
 
 
576 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  37.61 
 
 
558 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  35.93 
 
 
579 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  36.68 
 
 
558 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.66 
 
 
557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  34.63 
 
 
650 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
557 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  33.33 
 
 
557 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  35.29 
 
 
556 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.78 
 
 
553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.32 
 
 
548 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.12 
 
 
548 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  33.9 
 
 
557 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.75 
 
 
550 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  35.16 
 
 
556 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.64 
 
 
547 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.46 
 
 
547 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 
547 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  31.19 
 
 
544 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.03 
 
 
547 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.03 
 
 
547 aa  253  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.03 
 
 
547 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.03 
 
 
547 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.03 
 
 
547 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.34 
 
 
543 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.34 
 
 
543 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.15 
 
 
543 aa  247  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.06 
 
 
546 aa  242  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.57 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.32 
 
 
544 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.6 
 
 
554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
555 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  28.97 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.05 
 
 
514 aa  192  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  27.69 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2036  ABC transporter related  35.2 
 
 
544 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221493  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  23.21 
 
 
597 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  33.81 
 
 
618 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  28.82 
 
 
611 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.84 
 
 
594 aa  97.4  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  34.52 
 
 
573 aa  95.9  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  27.25 
 
 
1228 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  34.29 
 
 
522 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.12 
 
 
610 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3767  Sigma 54 interacting domain protein  34.72 
 
 
554 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0382723  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  25.34 
 
 
586 aa  94  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.34 
 
 
586 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>