More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1716 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 
520 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  62.75 
 
 
520 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  94.25 
 
 
522 aa  989    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  100 
 
 
522 aa  1045    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  66 
 
 
522 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  79.46 
 
 
544 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  76.27 
 
 
532 aa  748    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  64.06 
 
 
567 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  57.95 
 
 
521 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.73 
 
 
522 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  57.88 
 
 
546 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  56.92 
 
 
535 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  56.92 
 
 
534 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  57.09 
 
 
534 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  53.65 
 
 
533 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  54.33 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  54.04 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  53.09 
 
 
506 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  52.99 
 
 
533 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  52.5 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  53.4 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  51.16 
 
 
531 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
516 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  49.61 
 
 
533 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  51.88 
 
 
505 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  49.22 
 
 
533 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  52.44 
 
 
507 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  50.4 
 
 
511 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  50.1 
 
 
537 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  50.41 
 
 
504 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  50.72 
 
 
504 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  52.44 
 
 
507 aa  475  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  50.1 
 
 
516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  50.98 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  49.7 
 
 
533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  51.85 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  49.5 
 
 
519 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  50.1 
 
 
524 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  51.27 
 
 
512 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  50.2 
 
 
508 aa  465  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 
512 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  50.69 
 
 
512 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  48.24 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  50.2 
 
 
504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  47.66 
 
 
511 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  48.99 
 
 
524 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  51.2 
 
 
513 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  49.6 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  47.08 
 
 
509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  48.5 
 
 
516 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  47.37 
 
 
517 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  46.18 
 
 
517 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  50.1 
 
 
506 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
517 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  49.22 
 
 
506 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.71 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 
523 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  47.28 
 
 
508 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
511 aa  383  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 
508 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
510 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
510 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.84 
 
 
512 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
510 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
510 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 
510 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  44.53 
 
 
558 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 
511 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 
511 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 
510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
510 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.67 
 
 
513 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.81 
 
 
514 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
516 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.94 
 
 
511 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
510 aa  363  4e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  40.36 
 
 
509 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.6 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.76 
 
 
528 aa  358  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.3 
 
 
517 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
508 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.51 
 
 
509 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.89 
 
 
534 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.04 
 
 
518 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  42.09 
 
 
512 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
507 aa  350  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.24 
 
 
523 aa  350  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.51 
 
 
498 aa  350  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.48 
 
 
506 aa  349  8e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  40.59 
 
 
510 aa  349  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.35 
 
 
511 aa  348  1e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  39.06 
 
 
520 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  39.29 
 
 
510 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  40.95 
 
 
533 aa  347  3e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  39 
 
 
528 aa  346  6e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42.26 
 
 
532 aa  346  7e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40.04 
 
 
507 aa  345  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40.04 
 
 
507 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>