More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1291 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  100 
 
 
539 aa  1095    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  84.47 
 
 
533 aa  908    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  65.66 
 
 
516 aa  657    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  84.85 
 
 
533 aa  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  67.06 
 
 
531 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  62.15 
 
 
516 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  61.1 
 
 
511 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  61.24 
 
 
519 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  60.69 
 
 
537 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  61.41 
 
 
509 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  61.48 
 
 
524 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  60.89 
 
 
504 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  58.76 
 
 
511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  56.77 
 
 
524 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  60.2 
 
 
508 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  58.32 
 
 
530 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  58.1 
 
 
533 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  60.21 
 
 
504 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  57.46 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  55.89 
 
 
533 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  60.04 
 
 
512 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  55.51 
 
 
533 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  59.64 
 
 
512 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  59.84 
 
 
512 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  60.04 
 
 
512 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  54.49 
 
 
517 aa  545  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  57.52 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  56.25 
 
 
517 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  57.49 
 
 
516 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.2 
 
 
523 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 
517 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  57.43 
 
 
506 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 
523 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  54.14 
 
 
511 aa  519  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  57.2 
 
 
508 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  54.11 
 
 
506 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  57.23 
 
 
506 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  56.36 
 
 
527 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 
520 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  53.09 
 
 
520 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.43 
 
 
522 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  52.19 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  54.62 
 
 
507 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.97 
 
 
506 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  51.49 
 
 
522 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  54.62 
 
 
507 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 
567 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.44 
 
 
532 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  52.5 
 
 
522 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  51.23 
 
 
521 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  54.27 
 
 
546 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  51.57 
 
 
544 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  52.91 
 
 
535 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  52.1 
 
 
522 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  53.11 
 
 
534 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  52.55 
 
 
504 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  53.39 
 
 
534 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  50.31 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  41.68 
 
 
514 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  42.2 
 
 
509 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  43.26 
 
 
498 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  42.37 
 
 
507 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.25 
 
 
503 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  42.97 
 
 
507 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  42.97 
 
 
507 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.35 
 
 
534 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  42.28 
 
 
511 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  41.77 
 
 
521 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
507 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
511 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 
508 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.3 
 
 
510 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.46 
 
 
505 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  42.34 
 
 
528 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.08 
 
 
520 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  44.24 
 
 
517 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  43.57 
 
 
491 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  43.84 
 
 
527 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
510 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.22 
 
 
513 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  41.48 
 
 
509 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.62 
 
 
506 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
510 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.27 
 
 
512 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
501 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.77 
 
 
532 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.25 
 
 
514 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 
510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
508 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
510 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.87 
 
 
525 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  41.08 
 
 
509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.82 
 
 
512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>