More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1066 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  86.05 
 
 
512 aa  847    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  67.47 
 
 
533 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  68.01 
 
 
519 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  97.66 
 
 
512 aa  961    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  66.53 
 
 
508 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  66.6 
 
 
514 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  65.6 
 
 
537 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  100 
 
 
512 aa  1006    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  64.92 
 
 
533 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  68.54 
 
 
504 aa  657    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  66.26 
 
 
524 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  67.07 
 
 
533 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  99.61 
 
 
512 aa  1004    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  67.14 
 
 
509 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  66.4 
 
 
511 aa  669    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  64.62 
 
 
524 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  66.67 
 
 
508 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  66.87 
 
 
527 aa  631  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  64.73 
 
 
504 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  64.53 
 
 
516 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  60.24 
 
 
533 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  59.64 
 
 
539 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  59.84 
 
 
533 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  57.98 
 
 
516 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  56.86 
 
 
531 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  50.6 
 
 
517 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  54.55 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  54.22 
 
 
517 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  53.82 
 
 
517 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  54.93 
 
 
530 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  55.02 
 
 
513 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  51.87 
 
 
516 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  54.91 
 
 
523 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.91 
 
 
523 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  50.89 
 
 
520 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  50.69 
 
 
522 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.01 
 
 
522 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  50.3 
 
 
520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  50.98 
 
 
521 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.2 
 
 
532 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  50.5 
 
 
522 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  50.2 
 
 
506 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  52.25 
 
 
506 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  51.42 
 
 
511 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  49.09 
 
 
505 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.31 
 
 
544 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  51.27 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.04 
 
 
506 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  51.12 
 
 
539 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  50.74 
 
 
567 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  52.23 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  48.51 
 
 
522 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  50.8 
 
 
546 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  52.02 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  52.26 
 
 
504 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  48.61 
 
 
535 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  48.61 
 
 
534 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  48.91 
 
 
534 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  42.43 
 
 
514 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.77 
 
 
520 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  41.65 
 
 
503 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  48.8 
 
 
518 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  43.06 
 
 
509 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  42.72 
 
 
511 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.02 
 
 
505 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  45.05 
 
 
524 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
532 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
511 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 
511 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
501 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  44.16 
 
 
507 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  44.2 
 
 
510 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 
498 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  45.22 
 
 
529 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.64 
 
 
518 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  42.51 
 
 
506 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  42.32 
 
 
510 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.51 
 
 
506 aa  363  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.25 
 
 
527 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  44.09 
 
 
525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  40.93 
 
 
491 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
511 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
524 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
516 aa  360  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
507 aa  359  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  43.76 
 
 
503 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  42.63 
 
 
509 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  44.77 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.79 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  45.31 
 
 
534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  36.71 
 
 
514 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  37.72 
 
 
509 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 
510 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 
510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
510 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  43.54 
 
 
514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.05 
 
 
507 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>