More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1976 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  91.54 
 
 		 508 aa  923    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  75.38 
 
 		 524 aa  776    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  1038    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  64.59 
 
 		 533 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  73.5 
 
 		 537 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  66.07 
 
 		 512 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  96.03 
 
 		 504 aa  962    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  64.52 
 
 		 519 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  66.13 
 
 		 533 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  66.53 
 
 		 533 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  64.44 
 
 		 509 aa  631  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  64.66 
 
 		 514 aa  628  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  65.13 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  63.15 
 
 		 511 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  64.73 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  64.53 
 
 		 512 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  62.43 
 
 		 524 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  65.63 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  62.15 
 
 		 539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  62.8 
 
 		 508 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  59.61 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  59.22 
 
 		 533 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  61.87 
 
 		 527 aa  585  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  58.69 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  58.71 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  58.22 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 		 517 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.8 
 
 		 530 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  56.44 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  56.39 
 
 		 516 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  56.14 
 
 		 513 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  52.8 
 
 		 517 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.27 
 
 		 523 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  53.75 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  51.76 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  52.12 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  51.01 
 
 		 505 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  53.63 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  51.86 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  52.64 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  51.86 
 
 		 507 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.41 
 
 		 532 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  50.1 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  53.02 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  50.1 
 
 		 521 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  50.2 
 
 		 544 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  50.59 
 
 		 539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  50.7 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  52.28 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  50.29 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.7 
 
 		 522 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  50.2 
 
 		 534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  48.21 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 		 567 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  49.8 
 
 		 535 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  49.6 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 511 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.96 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.96 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.87 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.51 
 
 		 524 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  41.43 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.13 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.63 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  44.62 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  39.36 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.37 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.38 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.92 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.92 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.26 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.17 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.36 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.71 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  42.11 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  41.16 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  40.67 
 
 		 510 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  41.04 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  43.2 
 
 		 512 aa  362  8e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  43.63 
 
 		 504 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  43.39 
 
 		 558 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.34 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.4 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 508 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 507 aa  359  6e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.4 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>