More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6179 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  92.35 
 
 
507 aa  921    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  100 
 
 
510 aa  1004    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  79.02 
 
 
506 aa  795    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  77.84 
 
 
508 aa  778    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  69.86 
 
 
509 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  62.65 
 
 
506 aa  592  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  57.59 
 
 
511 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  52.91 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  55.05 
 
 
530 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  55.36 
 
 
550 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  53.77 
 
 
514 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  54.55 
 
 
534 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  54.89 
 
 
506 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  54.64 
 
 
506 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  54.89 
 
 
506 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  53.69 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  50.76 
 
 
567 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  44.91 
 
 
503 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  44.27 
 
 
513 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  44.96 
 
 
509 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  42.8 
 
 
509 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  46.08 
 
 
525 aa  408  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.89 
 
 
511 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
508 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  45.17 
 
 
511 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  45.67 
 
 
527 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  44.67 
 
 
503 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  44.47 
 
 
503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  46.32 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  46.73 
 
 
541 aa  402  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.8 
 
 
551 aa  398  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  41.72 
 
 
514 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.68 
 
 
518 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.57 
 
 
527 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
520 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  45.27 
 
 
512 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  47.45 
 
 
604 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  42.12 
 
 
510 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  46.77 
 
 
504 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  42.89 
 
 
518 aa  392  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.95 
 
 
517 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 
507 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
532 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 
511 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.83 
 
 
520 aa  388  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  41.73 
 
 
510 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  44.96 
 
 
534 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  42.77 
 
 
528 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  44.14 
 
 
515 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.53 
 
 
506 aa  385  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
534 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  46.23 
 
 
506 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42.32 
 
 
510 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
510 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
510 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  41 
 
 
509 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.03 
 
 
525 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
510 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  45.49 
 
 
558 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  44.14 
 
 
511 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  43.52 
 
 
524 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  44.62 
 
 
533 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
510 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.53 
 
 
508 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  43.03 
 
 
491 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  44.93 
 
 
525 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
532 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  44.94 
 
 
533 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.33 
 
 
511 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44.53 
 
 
548 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  40.12 
 
 
507 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  43.06 
 
 
518 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  45.92 
 
 
525 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  44.04 
 
 
527 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  42.03 
 
 
521 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  45.47 
 
 
477 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  43.09 
 
 
517 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  45.71 
 
 
551 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.04 
 
 
512 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  44.4 
 
 
547 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  42.91 
 
 
538 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 
523 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
505 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
502 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
524 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
516 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 
546 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.04 
 
 
534 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 
523 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  43 
 
 
509 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  41.73 
 
 
510 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  43.74 
 
 
545 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
514 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 
529 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>