More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4147 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  100 
 
 		 524 aa  999    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  43.44 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  44.29 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 545 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  43.52 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  44.92 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  46.12 
 
 		 504 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  43.99 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.57 
 
 		 527 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.97 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.75 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  45.75 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  43.52 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.75 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  41.02 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  45.72 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 516 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 520 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  45.03 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  44.98 
 
 		 604 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  43.08 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  40.7 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  45.24 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  37.57 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  45.03 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  37.79 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  44.02 
 
 		 529 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  43.27 
 
 		 514 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  43.27 
 
 		 514 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.15 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.9 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  45.05 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  39.04 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 507 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  43.13 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.62 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  45.05 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  44.81 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 		 534 aa  368  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  38.33 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.75 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  44.42 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.64 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  44.27 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  43.76 
 
 		 550 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  37.09 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  42.16 
 
 		 508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  46.14 
 
 		 498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.03 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  40.19 
 
 		 509 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  42.25 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  44.32 
 
 		 551 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.39 
 
 		 522 aa  360  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  42.77 
 
 		 537 aa  359  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.05 
 
 		 509 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  43.55 
 
 		 512 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.02 
 
 		 523 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  38.04 
 
 		 528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41.01 
 
 		 547 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  45.91 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  41.2 
 
 		 524 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  42.11 
 
 		 516 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 510 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  38.4 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  42.52 
 
 		 509 aa  355  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.91 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 532 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.31 
 
 		 528 aa  353  4e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5248  ABC transporter related  43.8 
 
 		 542 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.13 
 
 		 534 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  41.43 
 
 		 539 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 510 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  41.65 
 
 		 515 aa  352  7e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 510 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 		 510 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.56 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  43.35 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  37.62 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.38 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 523 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  40.31 
 
 		 551 aa  350  5e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  37.04 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.14 
 
 		 506 aa  350  5e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 524 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>