More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1121 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.27 
 
 		 522 aa  695    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  100 
 
 		 539 aa  1069    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  74.12 
 
 		 521 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  59.17 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  57.89 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  58.4 
 
 		 534 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  57.34 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  55.23 
 
 		 544 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  53.73 
 
 		 522 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  53.89 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  53.53 
 
 		 520 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  54.04 
 
 		 522 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.33 
 
 		 532 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  53.13 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 567 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  53.17 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  51.61 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  52.63 
 
 		 531 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  49.81 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  51.2 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  50 
 
 		 533 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  50.59 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  53.74 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  50.31 
 
 		 539 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  51.19 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  49.3 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  50.89 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  49.9 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  51.12 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.66 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  53.56 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  53.56 
 
 		 507 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  50.49 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.2 
 
 		 523 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  50.8 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  50.5 
 
 		 523 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  51.12 
 
 		 513 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  49.6 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  50 
 
 		 506 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  48.28 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  49.51 
 
 		 514 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  47.01 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  51.52 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 		 519 aa  438  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  48.1 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  50.4 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  51.33 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  49.31 
 
 		 524 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  51.12 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  47.9 
 
 		 533 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  51.12 
 
 		 512 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  49.48 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  46.68 
 
 		 533 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  46.29 
 
 		 533 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  49.7 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  45.96 
 
 		 508 aa  399  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  40.96 
 
 		 505 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.47 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.13 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  38.52 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  41.62 
 
 		 509 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  38.98 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 524 aa  346  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.87 
 
 		 534 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  39.11 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  37.63 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  41.19 
 
 		 527 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.08 
 
 		 528 aa  338  9.999999999999999e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  39.84 
 
 		 527 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.82 
 
 		 512 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 508 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.48 
 
 		 498 aa  336  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 508 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 510 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  37.1 
 
 		 507 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  41.52 
 
 		 506 aa  335  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  38.74 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  42.34 
 
 		 527 aa  334  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 		 503 aa  334  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.25 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 510 aa  333  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.69 
 
 		 513 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  37.52 
 
 		 511 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.08 
 
 		 532 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.16 
 
 		 530 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  36.93 
 
 		 509 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  37.63 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  39.16 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.32 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  40.12 
 
 		 547 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>