More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2176 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  100 
 
 
509 aa  1017    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  57.65 
 
 
505 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  49 
 
 
510 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  46.83 
 
 
511 aa  480  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  48.7 
 
 
503 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  47.51 
 
 
507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  48.29 
 
 
509 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  47.04 
 
 
521 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  45.88 
 
 
509 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  46.49 
 
 
513 aa  465  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  47 
 
 
498 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
508 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  44.88 
 
 
510 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
511 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 
507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  45.44 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  45.44 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  45.47 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.82 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  46.14 
 
 
528 aa  445  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  46.35 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  44.02 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  45.47 
 
 
502 aa  443  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.8 
 
 
512 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.73 
 
 
511 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  42.69 
 
 
514 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.16 
 
 
527 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  44.98 
 
 
510 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  48.19 
 
 
506 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46 
 
 
518 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1244  ABC transporter related  46 
 
 
533 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.21787 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
511 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.68 
 
 
506 aa  428  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  45.62 
 
 
510 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
520 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  43.78 
 
 
517 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.8 
 
 
528 aa  424  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  43.37 
 
 
518 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
506 aa  421  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  43.96 
 
 
533 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5419  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  45.53 
 
 
531 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2077  ABC transporter related  45 
 
 
529 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0945208 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.85 
 
 
512 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  41.2 
 
 
551 aa  413  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
524 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  43.23 
 
 
514 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
532 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  42.71 
 
 
509 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  43.78 
 
 
551 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  43.09 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
545 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  42.66 
 
 
558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  42.63 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  42.63 
 
 
520 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  41.11 
 
 
509 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
507 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  43.75 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  43.17 
 
 
604 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 
517 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  42.54 
 
 
503 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 
534 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  40.68 
 
 
514 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  42.28 
 
 
503 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.38 
 
 
530 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  41.92 
 
 
524 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
523 aa  392  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
511 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
506 aa  393  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  40.87 
 
 
509 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0533  ABC transporter related protein  43.63 
 
 
509 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  43.39 
 
 
529 aa  389  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  42.13 
 
 
509 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
522 aa  391  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  40.51 
 
 
500 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  42.51 
 
 
509 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41.13 
 
 
547 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.97 
 
 
534 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
516 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
521 aa  385  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.54 
 
 
506 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
505 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  42.83 
 
 
511 aa  380  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.13 
 
 
532 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0139  ATPase  41.82 
 
 
510 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  42.08 
 
 
533 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  41.53 
 
 
527 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  40.72 
 
 
503 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>