More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5055 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  100 
 
 		 521 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  74.12 
 
 		 539 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  65.1 
 
 		 522 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  54.97 
 
 		 520 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  56.89 
 
 		 544 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  58.72 
 
 		 546 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  57.95 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  55.36 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  58.33 
 
 		 535 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  58.33 
 
 		 534 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  57.75 
 
 		 522 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  55.31 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  58.02 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.06 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.31 
 
 		 530 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  53.24 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  52.52 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  52.11 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  53.24 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  51.2 
 
 		 533 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  51.23 
 
 		 539 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  50.3 
 
 		 533 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  50.1 
 
 		 516 aa  485  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.57 
 
 		 523 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  51.89 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  53.04 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  53.04 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.24 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  50.6 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  51.62 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  50.49 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  50.1 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  50.6 
 
 		 537 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  50.81 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 517 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  50.7 
 
 		 516 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  50.31 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  49.42 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  48.53 
 
 		 533 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  49.04 
 
 		 533 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  50 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  50.2 
 
 		 506 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  51.29 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  50.98 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  49.31 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  50.59 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  48.37 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  48.78 
 
 		 509 aa  448  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  51.2 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  48.09 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  49.69 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  49.32 
 
 		 527 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  48.39 
 
 		 519 aa  445  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  47.05 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  46.93 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.28 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.92 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.28 
 
 		 503 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  42.83 
 
 		 534 aa  356  5.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 511 aa  351  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.48 
 
 		 511 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  42.83 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 511 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.31 
 
 		 507 aa  348  9e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.31 
 
 		 507 aa  348  9e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.9 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.42 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.75 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  43.2 
 
 		 530 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  42.43 
 
 		 507 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.32 
 
 		 513 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  38.28 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.19 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.77 
 
 		 512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.85 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.96 
 
 		 528 aa  343  4e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.78 
 
 		 508 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 510 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  38.01 
 
 		 518 aa  342  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  41.68 
 
 		 527 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 524 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 510 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.39 
 
 		 510 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  37.8 
 
 		 509 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.4 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.67 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  43.08 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  38.15 
 
 		 509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 		 510 aa  339  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>