More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0213 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  78.04 
 
 		 513 aa  775    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  76.45 
 
 		 517 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  74.95 
 
 		 517 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  74.46 
 
 		 516 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  95.03 
 
 		 523 aa  951    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  57.11 
 
 		 517 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  56.59 
 
 		 531 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  59.44 
 
 		 530 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  56.29 
 
 		 533 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  56 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  55.67 
 
 		 533 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  55.15 
 
 		 537 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  55.86 
 
 		 524 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  54.47 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  55.17 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  53.36 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  53.43 
 
 		 511 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  54.69 
 
 		 509 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  54.18 
 
 		 533 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  52.83 
 
 		 533 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  55.17 
 
 		 512 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  53.25 
 
 		 508 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  53.16 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  53.27 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  52.44 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  53.75 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  52.1 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  54.6 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  54.4 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  52.3 
 
 		 521 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  54.6 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  53.66 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  52.96 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  53.09 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  53.42 
 
 		 524 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.08 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  51.19 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  51.79 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  54.04 
 
 		 527 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  52.64 
 
 		 504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  51.61 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  51.41 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  53.92 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  51.41 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  48.16 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  47.64 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  53.52 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  50.5 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  53.03 
 
 		 534 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  51.49 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.72 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  47.77 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  48.32 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  48.71 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  45.4 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  44.16 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.29 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.31 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  44.51 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  41.85 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 508 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.21 
 
 		 503 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  42.49 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  46.02 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.17 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.4 
 
 		 514 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  45.33 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40.56 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40.56 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  45.66 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  39.72 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  45.33 
 
 		 604 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  42.08 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.28 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.32 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 516 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.37 
 
 		 506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  38.84 
 
 		 509 aa  362  9e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 532 aa  362  9e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  42.91 
 
 		 534 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.32 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>