More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2145 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  100 
 
 		 546 aa  1055    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  75.55 
 
 		 534 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  76.1 
 
 		 534 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  75.55 
 
 		 535 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.38 
 
 		 522 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  58.72 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  57.88 
 
 		 522 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  58.05 
 
 		 544 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  57.34 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  57.87 
 
 		 506 aa  541  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.36 
 
 		 532 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  58.15 
 
 		 522 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  58.63 
 
 		 520 aa  532  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  56.47 
 
 		 520 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  57.11 
 
 		 530 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  56.6 
 
 		 522 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  57.75 
 
 		 511 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  56.44 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  55.83 
 
 		 531 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  57.48 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 567 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  57.48 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  53.59 
 
 		 533 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  54.27 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  56.95 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  52.89 
 
 		 533 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  54.6 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  51.74 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  50.96 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  50.7 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  50 
 
 		 533 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  52.73 
 
 		 508 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  49.7 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  51.54 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  51.1 
 
 		 533 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  51.07 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  51.96 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  49.13 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  53.83 
 
 		 527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  49.51 
 
 		 509 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  51.81 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  50.1 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  48.47 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  46.63 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  49.8 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  51 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.09 
 
 		 523 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  51.42 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  49.7 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  50.8 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  51.58 
 
 		 512 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  49.5 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  48.59 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.23 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.36 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 511 aa  353  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  38.23 
 
 		 503 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.9 
 
 		 508 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.04 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.54 
 
 		 528 aa  349  8e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  41.95 
 
 		 514 aa  349  8e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  44.31 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.54 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  43.33 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 		 510 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  41.4 
 
 		 509 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.8 
 
 		 510 aa  344  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  37.78 
 
 		 520 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  42.6 
 
 		 507 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  38.42 
 
 		 528 aa  341  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.46 
 
 		 514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 		 507 aa  340  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.76 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.76 
 
 		 507 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 517 aa  339  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  36.25 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  38.03 
 
 		 518 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  44.71 
 
 		 518 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  36.98 
 
 		 510 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42.52 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.59 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  41.54 
 
 		 510 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  37.45 
 
 		 509 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  38.09 
 
 		 509 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  37.13 
 
 		 513 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.04 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>