More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0496 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  75.3 
 
 		 511 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  74 
 
 		 507 aa  734    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  72.11 
 
 		 505 aa  724    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1019    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  66.4 
 
 		 504 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  74 
 
 		 507 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  73.4 
 
 		 506 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  57.74 
 
 		 530 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  58.13 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  55.71 
 
 		 533 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  55.65 
 
 		 531 aa  531  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  55.53 
 
 		 533 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  54.11 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  52.52 
 
 		 521 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  53.09 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  52.53 
 
 		 520 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  52.56 
 
 		 520 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  52.93 
 
 		 517 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  52.87 
 
 		 516 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  52.33 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 		 517 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  53.11 
 
 		 522 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  54.84 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  54.84 
 
 		 534 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  53.05 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  52.8 
 
 		 524 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  53.39 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  51.76 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  52.1 
 
 		 522 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.48 
 
 		 522 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  51.41 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  52.78 
 
 		 544 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.51 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  51.99 
 
 		 537 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  54.64 
 
 		 534 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  52.22 
 
 		 513 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  52.31 
 
 		 524 aa  488  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  52.3 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.6 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  51.11 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  51.9 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  51.2 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  51.19 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  52.16 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  52.65 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  51.76 
 
 		 533 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  50.7 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  51.01 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  50.3 
 
 		 514 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  51.51 
 
 		 527 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  50.4 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  50.91 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  50.2 
 
 		 512 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  50.4 
 
 		 512 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  49.01 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  47.7 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  48.3 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.4 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  42.32 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.89 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.92 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.36 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.09 
 
 		 530 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  40.72 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  40.04 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.66 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  40.12 
 
 		 502 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.12 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  37.72 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 510 aa  363  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 510 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.24 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.24 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 510 aa  362  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.36 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.81 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  41.81 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  38.31 
 
 		 528 aa  360  3e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 510 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  40.91 
 
 		 506 aa  360  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  41.62 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  39.92 
 
 		 509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.95 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.16 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  41.28 
 
 		 507 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  41.62 
 
 		 498 aa  355  7.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.8 
 
 		 509 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.2 
 
 		 514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  39.49 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>