More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0952 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  75.6 
 
 		 514 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  97.23 
 
 		 506 aa  929    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  97.43 
 
 		 506 aa  931    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1000    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  59.27 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  58.03 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  60.2 
 
 		 511 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  58.87 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  56.15 
 
 		 550 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  55.62 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  54.69 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  56.16 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  55.86 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  55.65 
 
 		 507 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  56 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  54.64 
 
 		 510 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  53.35 
 
 		 567 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  46.63 
 
 		 551 aa  438  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 511 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  47.7 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  47.89 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.55 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.55 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  47.48 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  43.43 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 508 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  44.73 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  43.82 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.74 
 
 		 503 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 510 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  43.89 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  44.35 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  42.8 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  42.74 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  49 
 
 		 518 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  42.09 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  43.66 
 
 		 510 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.42 
 
 		 528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.88 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  42.86 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  44.06 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  44.84 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  45.35 
 
 		 515 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  46.35 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 507 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  43.43 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.55 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  43.82 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  42.2 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.9 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.9 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.56 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 524 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.24 
 
 		 511 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  44 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.06 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.72 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 502 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 520 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44.42 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  45.65 
 
 		 534 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  44.16 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  44 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.32 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  41.84 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  44.14 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  45.31 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  45.4 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  44.82 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  42.83 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.9 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  39.73 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  44.65 
 
 		 533 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  39.72 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  38.23 
 
 		 521 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  44.16 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  38.97 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  38.02 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  40.72 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  41.63 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  45.29 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  38.23 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.24 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  45.2 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  45.06 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>