More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0344 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 		 506 aa  1005    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  75.4 
 
 		 514 aa  748    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  99.8 
 
 		 506 aa  1003    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  97.23 
 
 		 506 aa  932    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  60.55 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  57.65 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  59.27 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  59.48 
 
 		 506 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  56.94 
 
 		 550 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  56.2 
 
 		 534 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  55.09 
 
 		 506 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  56.09 
 
 		 507 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  55.8 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  56.2 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  56.36 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  54.89 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  53.73 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  47.7 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 511 aa  435  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  46.63 
 
 		 551 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  48.29 
 
 		 527 aa  435  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  43.55 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 508 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  45.53 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  47.89 
 
 		 525 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  44.18 
 
 		 514 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  43.91 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 510 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.54 
 
 		 503 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  44.29 
 
 		 509 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  44.6 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  43 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  42.94 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.9 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  49.6 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  43.86 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.94 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  44.47 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  42.21 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.8 
 
 		 528 aa  405  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.92 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.85 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  44.05 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  45.36 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  44.02 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  47.29 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.83 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.83 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  44.71 
 
 		 511 aa  395  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  42 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  47.36 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  43.98 
 
 		 548 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.35 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  43.79 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.72 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 532 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  41.2 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  43.61 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  43.76 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  40.88 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  45.85 
 
 		 534 aa  385  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  43.51 
 
 		 505 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  45.05 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  44.55 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  44.29 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  45.22 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  41.9 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  38.42 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  40.99 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  39.57 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  43.23 
 
 		 491 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.71 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  42.65 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  45.2 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  39.72 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  38.23 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  44.86 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  45.89 
 
 		 551 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  46.49 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  45.38 
 
 		 604 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>