More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6253 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  100 
 
 
503 aa  1002    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  49.3 
 
 
509 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  47.2 
 
 
510 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.68 
 
 
510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  48.68 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  49.29 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  48.68 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
510 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
510 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  47.99 
 
 
507 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  47.31 
 
 
528 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  48.16 
 
 
513 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  48.39 
 
 
521 aa  455  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  46.23 
 
 
514 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2122  ABC transporter related  50.2 
 
 
522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  49.41 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 
511 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
511 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  46.48 
 
 
510 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  45.24 
 
 
520 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  48.2 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  49.29 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  46.46 
 
 
509 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
506 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  46.34 
 
 
503 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  48.79 
 
 
527 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  46.26 
 
 
517 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  44.82 
 
 
505 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  47.25 
 
 
514 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  48.4 
 
 
533 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  44.56 
 
 
520 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  46.53 
 
 
510 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
521 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  49.21 
 
 
532 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.31 
 
 
528 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.77 
 
 
512 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  44.86 
 
 
509 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  49.08 
 
 
558 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  47.12 
 
 
515 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
502 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
511 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  46.15 
 
 
517 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 
523 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  46.71 
 
 
503 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  43.11 
 
 
510 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
507 aa  420  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
511 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  47.81 
 
 
477 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  46.88 
 
 
529 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  46.49 
 
 
512 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  46.31 
 
 
503 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  48.28 
 
 
551 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  45.96 
 
 
511 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  48.58 
 
 
506 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  44.18 
 
 
524 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  46.79 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  44.76 
 
 
518 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  44.83 
 
 
551 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  48.95 
 
 
604 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3655  ABC transporter related  45.42 
 
 
509 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.48 
 
 
518 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
510 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  44.92 
 
 
491 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  43.47 
 
 
527 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 
534 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  41.37 
 
 
515 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  41.93 
 
 
514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  43.18 
 
 
510 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.83 
 
 
506 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  44.31 
 
 
547 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  44.2 
 
 
516 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  45.56 
 
 
534 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.89 
 
 
522 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44.2 
 
 
548 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.69 
 
 
506 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  42.28 
 
 
509 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  43.91 
 
 
511 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 
507 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
532 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  42.04 
 
 
511 aa  390  1e-107  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
535 aa  391  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  42.74 
 
 
518 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  44.38 
 
 
515 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  41.32 
 
 
509 aa  386  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
524 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  43.6 
 
 
498 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.67 
 
 
505 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  43.37 
 
 
509 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  44.85 
 
 
532 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>