More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1298 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  64.77 
 
 		 518 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  79.96 
 
 		 538 aa  853    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  82.57 
 
 		 529 aa  888    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1056    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  61.4 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  61.6 
 
 		 503 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  57.09 
 
 		 515 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  57.68 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  57.14 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  59.16 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  59.16 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  58.76 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  57.49 
 
 		 511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  58.86 
 
 		 541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  59.29 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  56.09 
 
 		 509 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  53.71 
 
 		 546 aa  509  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  48.7 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  48.43 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  48.43 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  46.81 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  48.39 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 508 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  47.61 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.61 
 
 		 510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  47.85 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  47.46 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  46.97 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  45.81 
 
 		 525 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  47.7 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  45.73 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  46.89 
 
 		 558 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  46.6 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  45.7 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  46.33 
 
 		 517 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  47 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  47.54 
 
 		 504 aa  438  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  43.98 
 
 		 528 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  45.98 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  46.11 
 
 		 522 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  46.69 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.94 
 
 		 551 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  46.67 
 
 		 527 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  47.5 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  46.85 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  45.99 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  46.59 
 
 		 604 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  44.56 
 
 		 510 aa  425  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  46.12 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.95 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  44.31 
 
 		 524 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.63 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 511 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  42.23 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  45.38 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  46.08 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  44.09 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  45.17 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  45.14 
 
 		 547 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  45.28 
 
 		 527 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1446  ABC transporter-related protein  45.86 
 
 		 514 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  43.51 
 
 		 514 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  44.87 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  41.5 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  45.01 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  42.08 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  45 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  43.14 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.25 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  44.08 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1182  ABC transporter related  44.9 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42.22 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.6 
 
 		 528 aa  395  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 521 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  44.76 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  43.28 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  42.69 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  42.86 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0993  ABC transporter related  43.7 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>