More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3337 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  65.27 
 
 
511 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  75.31 
 
 
477 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  100 
 
 
511 aa  1012    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  77.5 
 
 
515 aa  789    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  76.89 
 
 
503 aa  774    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  76.29 
 
 
503 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  65.62 
 
 
525 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  64.27 
 
 
548 aa  631  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  65.15 
 
 
541 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  64.05 
 
 
525 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  64.24 
 
 
525 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  62.65 
 
 
518 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  63.12 
 
 
509 aa  611  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  58.28 
 
 
538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 
529 aa  581  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 
523 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  51.57 
 
 
510 aa  511  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  53.66 
 
 
509 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  53.31 
 
 
507 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  53.31 
 
 
507 aa  510  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  52.21 
 
 
513 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  53.27 
 
 
508 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  54.82 
 
 
558 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  52.59 
 
 
525 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  50.99 
 
 
510 aa  498  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  50.3 
 
 
528 aa  495  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  51.1 
 
 
507 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  51.99 
 
 
527 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  50.79 
 
 
503 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0562  ABC transporter-related protein  52.91 
 
 
546 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.136503 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  54.56 
 
 
518 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  51.86 
 
 
529 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  53.94 
 
 
551 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
510 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
510 aa  485  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
510 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  50.5 
 
 
511 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  51.99 
 
 
514 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
510 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  49.32 
 
 
509 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
510 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
508 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
510 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  50.69 
 
 
509 aa  484  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  52 
 
 
533 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
510 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 
511 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
510 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  49.4 
 
 
521 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  49.11 
 
 
551 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  50.49 
 
 
511 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  49.71 
 
 
510 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  52.48 
 
 
604 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 
522 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 
511 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  50.19 
 
 
509 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  50.8 
 
 
504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  50 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  48.43 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 
507 aa  468  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.8 
 
 
506 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  48.62 
 
 
520 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  50.59 
 
 
534 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  48.92 
 
 
547 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  49.9 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  48.51 
 
 
517 aa  461  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  49.51 
 
 
516 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  48.38 
 
 
545 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
523 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  49 
 
 
510 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  45.44 
 
 
510 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  47.53 
 
 
524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  46.39 
 
 
515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.63 
 
 
512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  47.99 
 
 
491 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.05 
 
 
528 aa  451  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  48.5 
 
 
518 aa  450  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  47.49 
 
 
527 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 
534 aa  450  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  50.98 
 
 
532 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  49.9 
 
 
505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  47.19 
 
 
510 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  48.93 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  46.14 
 
 
505 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
506 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  46.4 
 
 
521 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1529  ABC transporter related  46.68 
 
 
513 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  48.22 
 
 
512 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
524 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  48.39 
 
 
532 aa  423  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
510 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  45.03 
 
 
514 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  45.96 
 
 
503 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  45.36 
 
 
506 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1446  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  46.91 
 
 
506 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1498  ATPase  45.88 
 
 
513 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  46 
 
 
534 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>