More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4427 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  67.4 
 
 		 534 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  67.15 
 
 		 550 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  100 
 
 		 567 aa  1108    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  57.56 
 
 		 530 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  55.72 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  53.58 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  50.81 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.39 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  50.36 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  52.39 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  52.02 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  51 
 
 		 507 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  49.63 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  47.98 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  50.09 
 
 		 510 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  48.71 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  51.19 
 
 		 514 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  39.96 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.12 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  38.93 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.85 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.85 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  39.82 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  37.13 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.31 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  41.38 
 
 		 512 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.32 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  42.58 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  40.37 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  44.22 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.28 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  39.64 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 502 aa  362  9e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  42.68 
 
 		 534 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  36.73 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.06 
 
 		 528 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  41.88 
 
 		 541 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.62 
 
 		 511 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  37.06 
 
 		 510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  39.71 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 532 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  40.77 
 
 		 506 aa  356  6.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 507 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  40.37 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  39.1 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.39 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 		 510 aa  355  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 514 aa  354  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.33 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 		 510 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 510 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.35 
 
 		 510 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  36.79 
 
 		 510 aa  353  7e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 510 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 510 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  39.57 
 
 		 548 aa  350  5e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  41.35 
 
 		 503 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  42.25 
 
 		 525 aa  349  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  42.37 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  43.35 
 
 		 537 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  35.37 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  35.37 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  36.76 
 
 		 510 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 524 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.07 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  39.27 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  37.97 
 
 		 503 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.96 
 
 		 507 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  40.63 
 
 		 533 aa  343  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  33.52 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  35.11 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  38.63 
 
 		 517 aa  342  9e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1924  ABC transporter related  43.07 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0164399 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  36.92 
 
 		 518 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  40.57 
 
 		 514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1510  ATPase  41.17 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  35.11 
 
 		 510 aa  340  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  36.02 
 
 		 509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  38.07 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  36.18 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 501 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 535 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  39.31 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.09 
 
 		 532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  41.02 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  40.29 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  39.93 
 
 		 508 aa  334  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 545 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  36.72 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  39.46 
 
 		 515 aa  333  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>