More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3576 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  74.71 
 
 		 534 aa  718    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 550 aa  1075    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  67.35 
 
 		 567 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  62.18 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  57.89 
 
 		 514 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  58.13 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  56.75 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  56.63 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  53.77 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  56.44 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  53.37 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  55.84 
 
 		 506 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  53.44 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  55.36 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  52.98 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  53.47 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  55.4 
 
 		 514 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  45.9 
 
 		 525 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  45.1 
 
 		 517 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  46.05 
 
 		 527 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  44.07 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.5 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.04 
 
 		 514 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.18 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  40.35 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  41.07 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.98 
 
 		 506 aa  391  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  43.48 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.73 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 510 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.83 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.51 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.33 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.83 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3629  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 510 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.57 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.15 
 
 		 527 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  44.32 
 
 		 534 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  43.44 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  42.31 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.88 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  45.76 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  39.49 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  45.54 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  41.83 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40.04 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40.04 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.38 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  42.61 
 
 		 529 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  41.37 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  42.6 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  44.66 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 505 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  41.37 
 
 		 503 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.45 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.37 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  41.92 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  41.04 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  39.41 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  41.19 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  43.76 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 507 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  41.02 
 
 		 517 aa  363  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.76 
 
 		 521 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  42.57 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41.8 
 
 		 547 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  44.64 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  45.15 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 516 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  44.84 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  45.01 
 
 		 524 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  37.87 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 521 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 505 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  43.39 
 
 		 558 aa  359  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  41.97 
 
 		 541 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  39.29 
 
 		 538 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1510  ATPase  44.73 
 
 		 513 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>