More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3238 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  100 
 
 		 532 aa  1051    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  69.82 
 
 		 514 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  69.86 
 
 		 534 aa  667    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  66.07 
 
 		 517 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  74 
 
 		 503 aa  707    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  72.8 
 
 		 524 aa  697    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  70.91 
 
 		 506 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  75.6 
 
 		 507 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  48.2 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  48.51 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  48.2 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  48.59 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  47.04 
 
 		 510 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  46.09 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  49.42 
 
 		 517 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 510 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 510 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  49.42 
 
 		 551 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  47.89 
 
 		 511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  47.13 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  49.09 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  45.94 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  45.49 
 
 		 514 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  47.98 
 
 		 525 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  46.83 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  45.89 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  44.36 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  43.48 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 511 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 507 aa  429  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  44.4 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  46.06 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  46.79 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  47.19 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  49.09 
 
 		 533 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  48.36 
 
 		 551 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  47.61 
 
 		 545 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.49 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  44.75 
 
 		 518 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  46.17 
 
 		 547 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  47.52 
 
 		 604 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  46.98 
 
 		 532 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 522 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  45.54 
 
 		 524 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.01 
 
 		 528 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42.97 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  48.2 
 
 		 527 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  42.72 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  47.48 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  45.33 
 
 		 515 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  46.89 
 
 		 511 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  43.03 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  48.1 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.68 
 
 		 512 aa  412  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  45.38 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  45.73 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  42.97 
 
 		 527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.64 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  44.05 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  44.02 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  47.21 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.29 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.75 
 
 		 523 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 521 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  47.31 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44.82 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  42.14 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  39.52 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  44.75 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  45.58 
 
 		 525 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  46.14 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  44.96 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  46.26 
 
 		 503 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.29 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  45.19 
 
 		 525 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  44.75 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  45.27 
 
 		 510 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>