More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0934 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  71.14 
 
 
507 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  100 
 
 
505 aa  1016    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  72.11 
 
 
506 aa  717    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  74.85 
 
 
511 aa  725    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  65.93 
 
 
504 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  71.14 
 
 
507 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  71.14 
 
 
506 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.04 
 
 
530 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
517 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  54.18 
 
 
533 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  55.24 
 
 
517 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  53.88 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
520 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  53.94 
 
 
531 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  53.82 
 
 
516 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  56.44 
 
 
546 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  52.66 
 
 
520 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  51.7 
 
 
516 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  52.19 
 
 
539 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  52.11 
 
 
521 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  53.43 
 
 
513 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  55.24 
 
 
534 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.92 
 
 
522 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  54.84 
 
 
535 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  51.76 
 
 
544 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  50.3 
 
 
511 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  53.86 
 
 
567 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.1 
 
 
523 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  51.61 
 
 
539 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  51.01 
 
 
516 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  51.8 
 
 
522 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.9 
 
 
523 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  51.88 
 
 
522 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  54.23 
 
 
534 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  50.92 
 
 
504 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  51.21 
 
 
537 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  49.8 
 
 
509 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  51.3 
 
 
524 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  51.39 
 
 
522 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  51.52 
 
 
532 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  49.29 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  50.71 
 
 
508 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  49.49 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 
519 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  50.5 
 
 
533 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  48.79 
 
 
524 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  50.5 
 
 
533 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  49.49 
 
 
533 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  49.2 
 
 
511 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  50.93 
 
 
504 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  50.2 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  48.89 
 
 
512 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  48.69 
 
 
512 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  49.6 
 
 
508 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  49.09 
 
 
512 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  48.89 
 
 
512 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  48.62 
 
 
506 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  48.02 
 
 
506 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.86 
 
 
534 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
511 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 
511 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  41.37 
 
 
514 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.21 
 
 
510 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.48 
 
 
511 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
511 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  43.96 
 
 
506 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.42 
 
 
506 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 
510 aa  369  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  36.18 
 
 
514 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.17 
 
 
506 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  43.22 
 
 
506 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.13 
 
 
507 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
524 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.37 
 
 
507 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 
508 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 
510 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  39.29 
 
 
505 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.14 
 
 
514 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  38.29 
 
 
509 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
510 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
510 aa  360  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  41 
 
 
510 aa  360  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 
510 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
501 aa  360  5e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.35 
 
 
527 aa  359  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  36.29 
 
 
520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.6 
 
 
525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  37.65 
 
 
510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  41 
 
 
507 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  39.64 
 
 
530 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  37.22 
 
 
507 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  37.22 
 
 
507 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  37.82 
 
 
503 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  35.66 
 
 
509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  40.32 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 
511 aa  353  5e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.2 
 
 
513 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>