More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5003 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  73.89 
 
 
533 aa  760    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  68.42 
 
 
512 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  68.06 
 
 
512 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  73.15 
 
 
511 aa  737    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  69.64 
 
 
508 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  71.6 
 
 
514 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  69.09 
 
 
519 aa  679    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  66.87 
 
 
512 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  74.31 
 
 
533 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  74.64 
 
 
504 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  67.72 
 
 
524 aa  674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  73.5 
 
 
533 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  67.06 
 
 
512 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  100 
 
 
527 aa  1039    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  68.36 
 
 
509 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  62.09 
 
 
516 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  63.17 
 
 
524 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  61.3 
 
 
504 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  62.06 
 
 
508 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  61.55 
 
 
537 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  58.38 
 
 
531 aa  571  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  57.23 
 
 
533 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  56.84 
 
 
533 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  56.36 
 
 
539 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
516 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  55.36 
 
 
517 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  55.07 
 
 
517 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  49.71 
 
 
517 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  53.68 
 
 
530 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  51.83 
 
 
511 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  54.31 
 
 
523 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  54.67 
 
 
513 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
520 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  52.85 
 
 
516 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  53.95 
 
 
523 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  50.2 
 
 
520 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  51.51 
 
 
506 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 
522 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.8 
 
 
532 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  53.83 
 
 
546 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  50.49 
 
 
511 aa  465  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  49.9 
 
 
522 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  50.91 
 
 
505 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  49.09 
 
 
522 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  49.32 
 
 
521 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  52.43 
 
 
567 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.31 
 
 
522 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  51.63 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  52.24 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  51.63 
 
 
507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.99 
 
 
544 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  51.38 
 
 
535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  50.99 
 
 
534 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  51.82 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  51.9 
 
 
506 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  51 
 
 
504 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  51.09 
 
 
534 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  49.7 
 
 
539 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.16 
 
 
514 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  43 
 
 
511 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
511 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
511 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  38.13 
 
 
520 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.8 
 
 
507 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.8 
 
 
507 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.84 
 
 
503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  40 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.35 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.55 
 
 
506 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  41.35 
 
 
506 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  41.35 
 
 
506 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.09 
 
 
505 aa  352  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  41.88 
 
 
506 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  36 
 
 
509 aa  350  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.12 
 
 
517 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  36.35 
 
 
507 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 
534 aa  346  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
532 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
511 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  36.09 
 
 
509 aa  342  7e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.76 
 
 
513 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  40.86 
 
 
507 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  41.93 
 
 
529 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.57 
 
 
498 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.78 
 
 
534 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  41.94 
 
 
532 aa  340  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
507 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  43.24 
 
 
527 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  38.76 
 
 
509 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.19 
 
 
514 aa  340  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
501 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41 
 
 
547 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
516 aa  339  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  41.28 
 
 
514 aa  339  9e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  38.15 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  39.48 
 
 
518 aa  338  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  41.83 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  43 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  40.78 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>