More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1418 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  65.11 
 
 		 520 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  79.46 
 
 		 522 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1090    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  78.29 
 
 		 522 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  73.15 
 
 		 532 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  63.69 
 
 		 520 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  64 
 
 		 522 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  65.42 
 
 		 567 aa  623  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  56.89 
 
 		 521 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.41 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  58.05 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  56.4 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  56.4 
 
 		 534 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  55.23 
 
 		 539 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  55.99 
 
 		 534 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  52.14 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  51.76 
 
 		 505 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  52.78 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  50.1 
 
 		 533 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  50.1 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  51.79 
 
 		 539 aa  485  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  50 
 
 		 533 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  52.53 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  52.53 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  51.99 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  52.23 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  49.41 
 
 		 516 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  49.7 
 
 		 504 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  50.49 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  48.92 
 
 		 524 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  48.8 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  50.69 
 
 		 512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  47.55 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 519 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  47.67 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  50.1 
 
 		 504 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  47.71 
 
 		 524 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  47.28 
 
 		 533 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  48.32 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  47.8 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 512 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  48.67 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 517 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  47.31 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  47.74 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  48.79 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  47.22 
 
 		 533 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  47.65 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  48.64 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  48.44 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  46.14 
 
 		 517 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  47.31 
 
 		 513 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  45.63 
 
 		 514 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.33 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 523 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  47.31 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.62 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  44.14 
 
 		 558 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.84 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  41.02 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 510 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.92 
 
 		 514 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 508 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.96 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.9 
 
 		 534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  38.74 
 
 		 513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 		 534 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 516 aa  352  8.999999999999999e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.04 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  39.85 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  41.5 
 
 		 501 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.96 
 
 		 528 aa  349  7e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.73 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  38.61 
 
 		 520 aa  348  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  37.15 
 
 		 503 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 545 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.11 
 
 		 523 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  40.64 
 
 		 498 aa  347  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.28 
 
 		 506 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  39.77 
 
 		 510 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  36.8 
 
 		 509 aa  347  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.6 
 
 		 507 aa  346  6e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  42.8 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  40.7 
 
 		 512 aa  345  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  39.92 
 
 		 505 aa  343  2.9999999999999997e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42.29 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>