More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2173 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  100 
 
 		 508 aa  1019    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  91.14 
 
 		 504 aa  919    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  74.95 
 
 		 524 aa  750    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  74.36 
 
 		 537 aa  753    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  64.09 
 
 		 519 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  91.54 
 
 		 516 aa  922    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  64.76 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  67.28 
 
 		 512 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  65.87 
 
 		 512 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  66.87 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  64.37 
 
 		 533 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  66.67 
 
 		 512 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  64.3 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  64.31 
 
 		 514 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  66.32 
 
 		 504 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  64.98 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  63.97 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  63.01 
 
 		 524 aa  599  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  60.77 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  59.17 
 
 		 533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  61.75 
 
 		 508 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  58.97 
 
 		 533 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  61.84 
 
 		 527 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  58.15 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  58.2 
 
 		 531 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  57.35 
 
 		 511 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  56.04 
 
 		 530 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  56.85 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  57.23 
 
 		 517 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  56.55 
 
 		 517 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  56.56 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  51.2 
 
 		 517 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.24 
 
 		 523 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  53.83 
 
 		 523 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  52.3 
 
 		 506 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  52.02 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  53.63 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  51.47 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  53.63 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.59 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  53.39 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  52.45 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  52.73 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  52.25 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  50.71 
 
 		 505 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  51.19 
 
 		 539 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  50.81 
 
 		 521 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  50.79 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  50.3 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.39 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  50.2 
 
 		 522 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.34 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  50.29 
 
 		 544 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  49.09 
 
 		 522 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  51.65 
 
 		 567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  50.91 
 
 		 535 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  51.52 
 
 		 534 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  49.52 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  41.9 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.09 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 524 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  44.51 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.87 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  40.73 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  45.55 
 
 		 518 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.84 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.42 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  39.76 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40.37 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40.37 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.04 
 
 		 518 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.89 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  40.93 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.48 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.87 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.55 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.02 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40.36 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  43.11 
 
 		 529 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.65 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.27 
 
 		 527 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  40 
 
 		 509 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 501 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.27 
 
 		 506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.96 
 
 		 510 aa  362  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  43.64 
 
 		 498 aa  362  6e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  40.85 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  42.14 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  43 
 
 		 503 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  44.69 
 
 		 504 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.43 
 
 		 521 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  38.38 
 
 		 511 aa  359  6e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.83 
 
 		 530 aa  359  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 507 aa  358  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.62 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.52 
 
 		 506 aa  358  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  43.51 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>