More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6464 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  92.29 
 
 		 506 aa  922    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1008    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  57.43 
 
 		 539 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  56.13 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  57.58 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  55.91 
 
 		 533 aa  528  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  55.11 
 
 		 533 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 519 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  54.66 
 
 		 509 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  52.18 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  54.12 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  53.63 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  53.63 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.52 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  53.82 
 
 		 537 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  53.17 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  53.59 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  52.53 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  52.32 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  53.49 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  51.93 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  52.64 
 
 		 533 aa  472  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  52.84 
 
 		 533 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  53.31 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  49.3 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  51.79 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  52.73 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  51.2 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  51.9 
 
 		 533 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 504 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  49.7 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  53.6 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  52.3 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  50.97 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  48.42 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.64 
 
 		 544 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  49.21 
 
 		 520 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 		 522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.62 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  50.4 
 
 		 539 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  49.22 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  50.2 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  52.49 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  48.02 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  49.5 
 
 		 546 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  50.59 
 
 		 535 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  50.7 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  47.7 
 
 		 506 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  48.63 
 
 		 522 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  51.5 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 567 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  49.11 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  50.5 
 
 		 534 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  48.7 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  47.7 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  47.7 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.28 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.28 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  42.63 
 
 		 514 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 517 aa  359  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.35 
 
 		 505 aa  349  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.17 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  40.48 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  41.78 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.39 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.19 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.12 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  40.12 
 
 		 528 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.15 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.01 
 
 		 513 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  39.68 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  38.26 
 
 		 514 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  43.31 
 
 		 518 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  39.72 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.25 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  41.41 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  38.48 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  39.92 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.34 
 
 		 525 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  42.18 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  40.31 
 
 		 507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  41.11 
 
 		 503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.5 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  42.06 
 
 		 527 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  41.11 
 
 		 508 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 		 507 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  41.3 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  41.12 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  40.4 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  39.69 
 
 		 509 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  40.37 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>