More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1763 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  65.93 
 
 		 505 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  66.4 
 
 		 506 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  994    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  66.47 
 
 		 511 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  65.81 
 
 		 507 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  65.81 
 
 		 507 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  64.82 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  54.05 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  52.55 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 		 522 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  52.03 
 
 		 533 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  52.5 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  51.62 
 
 		 521 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  54.67 
 
 		 546 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  51.6 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  51.6 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  55.35 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  54.64 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  54.55 
 
 		 535 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  49.8 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  51.43 
 
 		 531 aa  475  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  53.74 
 
 		 539 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  51.64 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  53.39 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  52.32 
 
 		 537 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  53.18 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  53.05 
 
 		 523 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  52.28 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  51.33 
 
 		 519 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  48.77 
 
 		 511 aa  465  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  52.64 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  51.83 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  51.79 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  50.2 
 
 		 522 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  50.7 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  51.23 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  50.79 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  50.1 
 
 		 524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  50.1 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  50.31 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  49.59 
 
 		 533 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.8 
 
 		 522 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  53.09 
 
 		 512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.5 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  50.61 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  50.31 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  47.07 
 
 		 517 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  48.91 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  48.92 
 
 		 533 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  52.26 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  52.06 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  47.55 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  49.7 
 
 		 508 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  49.21 
 
 		 506 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  49.11 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  51 
 
 		 527 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 524 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  44.53 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  42.35 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.43 
 
 		 510 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  44.18 
 
 		 505 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  40.47 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.08 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 508 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  42.8 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.12 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.13 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.74 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.73 
 
 		 511 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 510 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.02 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  43.74 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  43.57 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  40.87 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  43.88 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  38.28 
 
 		 520 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.8 
 
 		 514 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.59 
 
 		 521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 		 517 aa  363  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  44.53 
 
 		 518 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.08 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.08 
 
 		 507 aa  362  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  39.21 
 
 		 510 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  38.54 
 
 		 503 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  40.77 
 
 		 491 aa  360  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  37.7 
 
 		 509 aa  360  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>