More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  67.19 
 
 		 503 aa  653    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  67.84 
 
 		 507 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  66.07 
 
 		 532 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 517 aa  1026    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  67.45 
 
 		 534 aa  664    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  77.08 
 
 		 514 aa  776    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  66 
 
 		 506 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  62.7 
 
 		 524 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  49.11 
 
 		 510 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  48.63 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  47.35 
 
 		 513 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  48.22 
 
 		 511 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  49.9 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  45.62 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  45.02 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  45.02 
 
 		 507 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  48.24 
 
 		 551 aa  435  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 511 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.95 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  44.05 
 
 		 514 aa  428  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  48.91 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  45.82 
 
 		 521 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  43.71 
 
 		 502 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  47.23 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  47.04 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  44.6 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  44.01 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  49.6 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  43.63 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  49.41 
 
 		 529 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  42.18 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  43.27 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  47.33 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  44.93 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  47.63 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  47.33 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  46.93 
 
 		 503 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  46.33 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 508 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  46.35 
 
 		 515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  47.61 
 
 		 534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  47.44 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  47.32 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.44 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  44.82 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  48.02 
 
 		 604 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  41.29 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  48.21 
 
 		 558 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  45.12 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  46.88 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 511 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  43 
 
 		 509 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  45.39 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  46.79 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  44.65 
 
 		 524 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.54 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  45.25 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  46.3 
 
 		 532 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.33 
 
 		 527 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2035  ABC transporter related  42.8 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.755376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.2 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  44.69 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  46.29 
 
 		 525 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 521 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.09 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4194  ABC transporter related  47.36 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  41.19 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42.72 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  41.65 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 		 522 aa  389  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  45.99 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  42.26 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  44.4 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl668  ribose ABC transporter ATP-binding component  40.35 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2114  ABC transporter related protein  40.63 
 
 		 506 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235727  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  43.76 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  46.81 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  42.35 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  43.7 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  46.27 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  43 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  43.55 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  38.64 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0916  ABC transporter related  39.6 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>