More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0838 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  100 
 
 
516 aa  1045    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  65.01 
 
 
533 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  66.06 
 
 
533 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  65.48 
 
 
531 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  65.66 
 
 
539 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  60.28 
 
 
533 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  58.35 
 
 
511 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  58.55 
 
 
509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  58.59 
 
 
511 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  58.17 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  54.8 
 
 
517 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  58.84 
 
 
514 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  56.66 
 
 
533 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
519 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  58.69 
 
 
524 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  57.98 
 
 
537 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  58.71 
 
 
516 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  58.03 
 
 
524 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  57.91 
 
 
513 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  59.03 
 
 
504 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  59.34 
 
 
504 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  55.53 
 
 
517 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  56.67 
 
 
516 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  58.15 
 
 
508 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.2 
 
 
523 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  55.53 
 
 
517 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  58.38 
 
 
512 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
523 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  58.47 
 
 
512 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  57.98 
 
 
512 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  58.18 
 
 
512 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.73 
 
 
530 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  56.97 
 
 
508 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  55.73 
 
 
527 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  52.06 
 
 
511 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  56.13 
 
 
506 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  51.7 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  55.53 
 
 
506 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  52.33 
 
 
506 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  52.54 
 
 
506 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.18 
 
 
522 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  51.17 
 
 
507 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.04 
 
 
522 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  50 
 
 
522 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  48.65 
 
 
522 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  51.17 
 
 
507 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  50.1 
 
 
521 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
520 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  49.9 
 
 
520 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  51.63 
 
 
546 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.19 
 
 
532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 
567 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  50.41 
 
 
504 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  51.63 
 
 
535 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  49.3 
 
 
539 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  51.42 
 
 
534 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.13 
 
 
544 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  52.03 
 
 
534 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.45 
 
 
505 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.58 
 
 
508 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
511 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.4 
 
 
511 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.35 
 
 
510 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  41.3 
 
 
509 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  39.76 
 
 
507 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
510 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.76 
 
 
507 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.25 
 
 
506 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  39.53 
 
 
514 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
507 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 
511 aa  379  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  39.48 
 
 
520 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
510 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 
510 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  41.97 
 
 
534 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.25 
 
 
512 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  38.9 
 
 
507 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 
510 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 
510 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
511 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
532 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  41.16 
 
 
517 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.45 
 
 
516 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  40.08 
 
 
527 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  41.32 
 
 
524 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 
534 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  39.72 
 
 
511 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  41.76 
 
 
527 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  40.48 
 
 
551 aa  364  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  38.96 
 
 
510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  40.99 
 
 
510 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
506 aa  362  9e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  39.27 
 
 
524 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  39.64 
 
 
528 aa  361  2e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  37.99 
 
 
521 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.08 
 
 
506 aa  356  6.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>