More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2571 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  100 
 
 
552 aa  1115    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  33.58 
 
 
546 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  33.33 
 
 
560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.66 
 
 
567 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  33.7 
 
 
555 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  32.43 
 
 
566 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  30.96 
 
 
579 aa  292  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  32.07 
 
 
581 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  31.67 
 
 
553 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  32.52 
 
 
564 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  33.82 
 
 
548 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 
554 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.09 
 
 
564 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  34.62 
 
 
558 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  32.78 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.46 
 
 
581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  32.27 
 
 
607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  32.27 
 
 
607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  32.27 
 
 
607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
581 aa  273  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  31.56 
 
 
581 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  32.64 
 
 
550 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  31.56 
 
 
581 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  30.09 
 
 
551 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  31.93 
 
 
551 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  32.69 
 
 
551 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.17 
 
 
562 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
562 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.39 
 
 
564 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  33.84 
 
 
549 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 
562 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  32.97 
 
 
588 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  31.76 
 
 
562 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.71 
 
 
547 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.71 
 
 
547 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  33.61 
 
 
571 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.71 
 
 
547 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  31.71 
 
 
547 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.71 
 
 
547 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  31.71 
 
 
547 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.71 
 
 
547 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  32.57 
 
 
554 aa  260  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.5 
 
 
547 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.89 
 
 
548 aa  260  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  29.72 
 
 
576 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  33.27 
 
 
546 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  30.72 
 
 
557 aa  259  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.3 
 
 
547 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.35 
 
 
547 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  32.05 
 
 
552 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.58 
 
 
542 aa  256  9e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.97 
 
 
550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.8 
 
 
550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  32.5 
 
 
562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.94 
 
 
548 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  33.97 
 
 
597 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  29.93 
 
 
1032 aa  251  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.16 
 
 
650 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  29.82 
 
 
558 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  32.52 
 
 
558 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.24 
 
 
557 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.09 
 
 
1055 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  29.14 
 
 
544 aa  245  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  31.12 
 
 
556 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 
543 aa  242  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 
543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 
553 aa  240  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.5 
 
 
543 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  31.13 
 
 
556 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.17 
 
 
544 aa  238  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.55 
 
 
557 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 
555 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  30.43 
 
 
557 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  29.96 
 
 
554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  31.13 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.49 
 
 
514 aa  210  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.37 
 
 
549 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  24.52 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.06 
 
 
592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  24 
 
 
596 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  25.31 
 
 
614 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  26.19 
 
 
1228 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.84 
 
 
610 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1695  ABC transporter related  24.31 
 
 
593 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155149 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  25.68 
 
 
601 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.95 
 
 
573 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.36 
 
 
573 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  25.13 
 
 
718 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  25.34 
 
 
583 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>