More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1536 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  95.7 
 
 		 607 aa  1112    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  95.35 
 
 		 581 aa  1111    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  80.4 
 
 		 562 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.94 
 
 		 562 aa  887    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  99.31 
 
 		 581 aa  1146    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  80.84 
 
 		 588 aa  922    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  81.77 
 
 		 562 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  95.35 
 
 		 607 aa  1108    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  92.76 
 
 		 581 aa  1083    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  100 
 
 		 581 aa  1155    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  95.35 
 
 		 607 aa  1108    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.58 
 
 		 562 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  76.99 
 
 		 597 aa  775    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  48.62 
 
 		 553 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  47.32 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  48.19 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  47.48 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  41.76 
 
 		 546 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  39.03 
 
 		 548 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  37.59 
 
 		 552 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  36.96 
 
 		 549 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  37.77 
 
 		 550 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  36.65 
 
 		 550 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  36.94 
 
 		 551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  38.48 
 
 		 564 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  38.91 
 
 		 571 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  34.17 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  36.22 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  33.75 
 
 		 558 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  37.96 
 
 		 567 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.37 
 
 		 554 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  36.94 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.94 
 
 		 564 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  37.65 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  37.94 
 
 		 563 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.24 
 
 		 564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  36.53 
 
 		 554 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  32.66 
 
 		 551 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  34.16 
 
 		 558 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  37.97 
 
 		 556 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.27 
 
 		 1032 aa  281  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.51 
 
 		 1055 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  38.51 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 548 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.6 
 
 		 557 aa  277  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  37.94 
 
 		 556 aa  276  8e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.52 
 
 		 551 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.37 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.15 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  31.56 
 
 		 552 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.39 
 
 		 547 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.39 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.21 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  32.41 
 
 		 544 aa  266  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.21 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.67 
 
 		 547 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  32.67 
 
 		 547 aa  266  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.67 
 
 		 547 aa  266  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  32.67 
 
 		 547 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.67 
 
 		 547 aa  266  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.21 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.09 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.49 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.49 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.49 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.8 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.32 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  36.58 
 
 		 555 aa  257  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  32.84 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  30.96 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  29.38 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  34.84 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.12 
 
 		 557 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.63 
 
 		 542 aa  217  4e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.54 
 
 		 543 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.54 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.54 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  26.52 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  25.97 
 
 		 554 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.46 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  26.52 
 
 		 541 aa  190  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  27.11 
 
 		 549 aa  177  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  26.22 
 
 		 514 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.77 
 
 		 608 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.18 
 
 		 608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 595 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  25.93 
 
 		 668 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  28.39 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  28.76 
 
 		 610 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 610 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  27.7 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  28.21 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  27.85 
 
 		 605 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.71 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>