More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1956 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  100 
 
 		 544 aa  1101    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.73 
 
 		 557 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  38.08 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  33.09 
 
 		 546 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  32.05 
 
 		 554 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.88 
 
 		 650 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.27 
 
 		 549 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  33.52 
 
 		 552 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.14 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  33.82 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.56 
 
 		 1055 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  33.46 
 
 		 607 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  33.46 
 
 		 607 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  31.84 
 
 		 550 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  33.46 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.82 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  31.51 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  34.18 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  32.41 
 
 		 581 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.9 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  32.36 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  31.24 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  31.33 
 
 		 567 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  32.05 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.15 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.08 
 
 		 554 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  31.64 
 
 		 562 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  31.77 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  31.19 
 
 		 555 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  31.67 
 
 		 1032 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.93 
 
 		 564 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  34.09 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  30.02 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  29.14 
 
 		 552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  32.04 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.47 
 
 		 557 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  30.57 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.62 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  29.39 
 
 		 553 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  33.01 
 
 		 551 aa  239  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  31.27 
 
 		 597 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  36 
 
 		 557 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  31.49 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.71 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  34.79 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.71 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.52 
 
 		 543 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  31.4 
 
 		 554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.78 
 
 		 564 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  31.3 
 
 		 563 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.75 
 
 		 547 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.75 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.75 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.75 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.75 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  30.88 
 
 		 571 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  30.54 
 
 		 579 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.95 
 
 		 548 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  31.52 
 
 		 558 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.51 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.25 
 
 		 547 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.43 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.43 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.43 
 
 		 547 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.43 
 
 		 547 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.22 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.22 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  30.22 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  32.25 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  30.22 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.22 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.4 
 
 		 542 aa  221  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  37.22 
 
 		 556 aa  220  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  29.74 
 
 		 576 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.98 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  29.49 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  36.67 
 
 		 556 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.32 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  27.4 
 
 		 557 aa  203  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.44 
 
 		 544 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.24 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.92 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  25.54 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1504  ABC transporter related  30.69 
 
 		 231 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.211906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  25.87 
 
 		 726 aa  97.4  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  32.45 
 
 		 625 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  27.07 
 
 		 725 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  31.36 
 
 		 611 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  31.19 
 
 		 216 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  24.13 
 
 		 612 aa  95.1  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  24.18 
 
 		 595 aa  94.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  22.72 
 
 		 596 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  23.77 
 
 		 627 aa  94  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>