More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1675 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  100 
 
 		 551 aa  1124    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  31.71 
 
 		 576 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  35.55 
 
 		 546 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  35.86 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  34.22 
 
 		 555 aa  310  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  34.5 
 
 		 558 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.65 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.71 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  34.71 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  37.76 
 
 		 548 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  34.62 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  33.81 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  33.93 
 
 		 607 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  33.93 
 
 		 607 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  33.93 
 
 		 607 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.62 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  33.2 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.32 
 
 		 567 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  33.75 
 
 		 550 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 562 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  33.47 
 
 		 581 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  34.25 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  32.66 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  32.9 
 
 		 551 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  32.99 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  33.2 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  31.59 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  33.96 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  31.93 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.22 
 
 		 549 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.38 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  36.59 
 
 		 1055 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.31 
 
 		 564 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.45 
 
 		 564 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  32.23 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  30.74 
 
 		 579 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  32.62 
 
 		 554 aa  249  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.66 
 
 		 551 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.17 
 
 		 547 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.37 
 
 		 547 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  31.13 
 
 		 557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  29.96 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  32.35 
 
 		 558 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  32.7 
 
 		 558 aa  243  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.57 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.36 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.3 
 
 		 542 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  31.53 
 
 		 556 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.94 
 
 		 547 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  30.58 
 
 		 563 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.21 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.21 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.21 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.94 
 
 		 547 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.31 
 
 		 543 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.1 
 
 		 543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  30.07 
 
 		 557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.1 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  33.67 
 
 		 650 aa  234  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  31.81 
 
 		 556 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  31.09 
 
 		 564 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  34.16 
 
 		 1032 aa  231  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.33 
 
 		 553 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.81 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  32.25 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.94 
 
 		 546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  33.33 
 
 		 541 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.9 
 
 		 544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.28 
 
 		 557 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  30.06 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  27.84 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  25.46 
 
 		 514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  34.13 
 
 		 549 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.47 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.39 
 
 		 566 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  27.06 
 
 		 892 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  24.16 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  29.8 
 
 		 575 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  24.78 
 
 		 725 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  24.27 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.8 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.62 
 
 		 721 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.81 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  24.21 
 
 		 597 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  23.24 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>