More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2574 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  62.5 
 
 
595 aa  727    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  70.88 
 
 
577 aa  793    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  70.21 
 
 
580 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  100 
 
 
579 aa  1120    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  68.63 
 
 
577 aa  773    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  56.72 
 
 
611 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  59.03 
 
 
581 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  56.78 
 
 
590 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.1 
 
 
601 aa  567  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  54.83 
 
 
579 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
581 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  49.91 
 
 
581 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
646 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  50.43 
 
 
579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
579 aa  445  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.83 
 
 
608 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  40.68 
 
 
668 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.82 
 
 
581 aa  325  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  40.41 
 
 
610 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.69 
 
 
610 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  38.32 
 
 
628 aa  294  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  38.72 
 
 
574 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
578 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  36.61 
 
 
605 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33 
 
 
610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.81 
 
 
626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.28 
 
 
610 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.28 
 
 
610 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.97 
 
 
595 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
609 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 
606 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.76 
 
 
631 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.31 
 
 
600 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  34.31 
 
 
634 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  32.92 
 
 
615 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.75 
 
 
614 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.14 
 
 
606 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.16 
 
 
598 aa  247  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.8 
 
 
596 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.24 
 
 
598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.92 
 
 
618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.39 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 
598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.51 
 
 
595 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  34.78 
 
 
658 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  35.02 
 
 
658 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.56 
 
 
634 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.13 
 
 
621 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.07 
 
 
598 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.71 
 
 
609 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.34 
 
 
608 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.68 
 
 
602 aa  242  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.71 
 
 
598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  27.55 
 
 
598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.51 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.89 
 
 
672 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.96 
 
 
556 aa  240  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  34.47 
 
 
620 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
620 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  28.55 
 
 
606 aa  239  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  24.87 
 
 
582 aa  238  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 
598 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.01 
 
 
595 aa  238  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  32.8 
 
 
606 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  33.28 
 
 
632 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.45 
 
 
640 aa  237  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.07 
 
 
571 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.89 
 
 
571 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 
571 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  33.95 
 
 
620 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.89 
 
 
571 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.89 
 
 
571 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.12 
 
 
617 aa  236  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 
571 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  29.64 
 
 
596 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.49 
 
 
629 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.13 
 
 
625 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.71 
 
 
571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.77 
 
 
591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  31.61 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  29.76 
 
 
617 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.48 
 
 
666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  26.09 
 
 
628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.71 
 
 
614 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  26.54 
 
 
598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  27.55 
 
 
576 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  27 
 
 
584 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  31.55 
 
 
631 aa  234  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  27.12 
 
 
598 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.12 
 
 
598 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.12 
 
 
598 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.12 
 
 
598 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.54 
 
 
571 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  31.92 
 
 
623 aa  233  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.12 
 
 
598 aa  233  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  26.67 
 
 
594 aa  233  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.62 
 
 
575 aa  233  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.71 
 
 
571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>