More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3049 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1115    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  51.55 
 
 		 578 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  44.08 
 
 		 608 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  40.53 
 
 		 668 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.15 
 
 		 626 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.2 
 
 		 610 aa  342  8e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 609 aa  342  9e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  39.73 
 
 		 610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  42.01 
 
 		 601 aa  317  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  38.87 
 
 		 595 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  39.93 
 
 		 628 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  38.04 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  38 
 
 		 611 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  39.15 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  35.58 
 
 		 577 aa  288  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  38.08 
 
 		 581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  38.45 
 
 		 590 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.81 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.4 
 
 		 580 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 646 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  36.44 
 
 		 579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.84 
 
 		 627 aa  223  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.74 
 
 		 581 aa  219  7e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.73 
 
 		 614 aa  219  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  31.84 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  31.7 
 
 		 597 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  30.86 
 
 		 626 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 628 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  32.71 
 
 		 616 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  30.64 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  30.64 
 
 		 627 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 640 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  31.56 
 
 		 622 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.23 
 
 		 614 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  31.36 
 
 		 606 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.19 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.68 
 
 		 610 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.68 
 
 		 610 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  32.01 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  29.58 
 
 		 640 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  30.9 
 
 		 610 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  53.82 
 
 		 666 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.25 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  30.44 
 
 		 654 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.52 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  30.73 
 
 		 634 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  32.6 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  31.75 
 
 		 620 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  27.94 
 
 		 575 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  29.53 
 
 		 615 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  31.39 
 
 		 637 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.51 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.41 
 
 		 622 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  27.77 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  24.82 
 
 		 618 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  28.3 
 
 		 591 aa  194  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  28.91 
 
 		 629 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  29.13 
 
 		 619 aa  193  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.09 
 
 		 621 aa  192  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  29.6 
 
 		 641 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  30.69 
 
 		 637 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  28.85 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.75 
 
 		 627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  30.43 
 
 		 648 aa  191  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  28.86 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  30.35 
 
 		 663 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  28.86 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  28.86 
 
 		 629 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  25.95 
 
 		 583 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  27.48 
 
 		 625 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  30.33 
 
 		 632 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  29.6 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  31.59 
 
 		 635 aa  188  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 624 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  29.72 
 
 		 638 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  27.33 
 
 		 623 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  31.05 
 
 		 672 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  30.03 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  28.42 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  25.5 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  23.52 
 
 		 618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  31.07 
 
 		 659 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 642 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.17 
 
 		 637 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  30.49 
 
 		 638 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  29.61 
 
 		 631 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.34 
 
 		 618 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.84 
 
 		 608 aa  183  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  29.72 
 
 		 687 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.4 
 
 		 617 aa  184  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  27.38 
 
 		 611 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>