More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 601 aa  1167    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  57.93 
 
 		 577 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  57.41 
 
 		 577 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.51 
 
 		 580 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  54.47 
 
 		 611 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  56.43 
 
 		 590 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  53.01 
 
 		 595 aa  561  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  55.14 
 
 		 581 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  54.17 
 
 		 579 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 581 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 581 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  49 
 
 		 646 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  49.56 
 
 		 579 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.03 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  39.21 
 
 		 668 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  37.77 
 
 		 608 aa  313  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.34 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  40.58 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  37.99 
 
 		 574 aa  290  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.85 
 
 		 610 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.66 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.66 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 601 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 578 aa  276  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  39.9 
 
 		 628 aa  276  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.49 
 
 		 605 aa  273  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  35.5 
 
 		 634 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  36.53 
 
 		 672 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  29.1 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  32.25 
 
 		 619 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  28.57 
 
 		 597 aa  254  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  34.36 
 
 		 615 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.94 
 
 		 598 aa  254  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 609 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  27.72 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.13 
 
 		 637 aa  249  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 614 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 661 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.4 
 
 		 595 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  33.56 
 
 		 658 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 620 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  35.25 
 
 		 633 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.07 
 
 		 595 aa  244  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  34.13 
 
 		 616 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.52 
 
 		 575 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  32.36 
 
 		 658 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.02 
 
 		 626 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.89 
 
 		 589 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.87 
 
 		 606 aa  243  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 811 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 600 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.59 
 
 		 598 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.75 
 
 		 666 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.12 
 
 		 618 aa  241  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 		 598 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.42 
 
 		 598 aa  239  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.65 
 
 		 587 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.05 
 
 		 608 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  32.61 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  33.39 
 
 		 687 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.31 
 
 		 618 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  33.27 
 
 		 672 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  30.24 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  30.44 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  31.17 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.78 
 
 		 614 aa  238  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.24 
 
 		 587 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.52 
 
 		 597 aa  238  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.52 
 
 		 597 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.31 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.82 
 
 		 1257 aa  237  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 598 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  32.57 
 
 		 652 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.24 
 
 		 587 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.42 
 
 		 594 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  32.63 
 
 		 620 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  30.22 
 
 		 603 aa  236  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.24 
 
 		 598 aa  236  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.71 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  25.88 
 
 		 636 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  33.08 
 
 		 669 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  26.72 
 
 		 628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.92 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.71 
 
 		 1436 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 		 637 aa  234  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 623 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  29.77 
 
 		 608 aa  234  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.88 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.4 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  30.77 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 		 586 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  32.28 
 
 		 641 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.11 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>