More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8452 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  65.4 
 
 		 611 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  100 
 
 		 581 aa  1123    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  65.53 
 
 		 579 aa  697    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  59.03 
 
 		 579 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  56.87 
 
 		 577 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 577 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  53.11 
 
 		 595 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 581 aa  571  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  53.87 
 
 		 581 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  55.29 
 
 		 590 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.63 
 
 		 580 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.38 
 
 		 601 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  53.11 
 
 		 579 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  50.67 
 
 		 646 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  44.23 
 
 		 579 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  39.75 
 
 		 668 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.62 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.9 
 
 		 608 aa  326  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.37 
 
 		 610 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 578 aa  308  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  38.08 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  38.4 
 
 		 610 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 601 aa  293  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  38.28 
 
 		 666 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  36.23 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  36.72 
 
 		 628 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 609 aa  263  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.99 
 
 		 610 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.42 
 
 		 626 aa  259  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.81 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.81 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.17 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.06 
 
 		 605 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  34.62 
 
 		 619 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.14 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.77 
 
 		 625 aa  251  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  30.89 
 
 		 666 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  34.08 
 
 		 634 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  25.82 
 
 		 618 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 614 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  32.58 
 
 		 652 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34 
 
 		 606 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  35.65 
 
 		 616 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  27.37 
 
 		 625 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.39 
 
 		 575 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 		 672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  28.42 
 
 		 671 aa  243  6e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  30.68 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.3 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  31.3 
 
 		 615 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.58 
 
 		 595 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  34.06 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.82 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  27.53 
 
 		 594 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 620 aa  238  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.81 
 
 		 598 aa  237  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.11 
 
 		 615 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.14 
 
 		 634 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.94 
 
 		 597 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.05 
 
 		 1301 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.4 
 
 		 600 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  31.83 
 
 		 811 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  31.33 
 
 		 672 aa  236  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  28.99 
 
 		 590 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.44 
 
 		 586 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.23 
 
 		 637 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 596 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.33 
 
 		 591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  26.62 
 
 		 620 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 636 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  30.96 
 
 		 642 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.22 
 
 		 567 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  27.51 
 
 		 640 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.67 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  31.23 
 
 		 595 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.2 
 
 		 567 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  27.55 
 
 		 592 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  23.47 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  29.98 
 
 		 669 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  30.92 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  31.56 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  27.66 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 		 598 aa  231  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 621 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.08 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.1 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.51 
 
 		 578 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.95 
 
 		 629 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.14 
 
 		 567 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  29.98 
 
 		 637 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 620 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.59 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  29.73 
 
 		 585 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.06 
 
 		 586 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.35 
 
 		 585 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  29.55 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30.33 
 
 		 638 aa  230  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  32.17 
 
 		 592 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.57 
 
 		 670 aa  230  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>