More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2081 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  100 
 
 
581 aa  1142    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  53.2 
 
 
611 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
581 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  53.98 
 
 
581 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  53.89 
 
 
577 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
579 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  52.07 
 
 
579 aa  525  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
579 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  50.17 
 
 
577 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  48.36 
 
 
595 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
646 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  50.17 
 
 
590 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.6 
 
 
601 aa  475  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.22 
 
 
580 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  44.78 
 
 
579 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.85 
 
 
581 aa  336  5.999999999999999e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  40.98 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  37.68 
 
 
608 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  39.9 
 
 
574 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.29 
 
 
668 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.02 
 
 
610 aa  299  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
601 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  36.1 
 
 
610 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  37.65 
 
 
628 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  34.96 
 
 
609 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.26 
 
 
595 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.31 
 
 
605 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
598 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.15 
 
 
610 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  33.52 
 
 
663 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  26.04 
 
 
631 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.98 
 
 
610 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.98 
 
 
610 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.62 
 
 
640 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 
606 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.9 
 
 
666 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  34.63 
 
 
672 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.51 
 
 
608 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 
634 aa  243  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  32.63 
 
 
619 aa  242  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.94 
 
 
622 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
811 aa  242  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.62 
 
 
571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.62 
 
 
571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.69 
 
 
670 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.62 
 
 
571 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
571 aa  241  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 
571 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  32.49 
 
 
652 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.62 
 
 
571 aa  239  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.65 
 
 
621 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.53 
 
 
606 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  29.36 
 
 
607 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.45 
 
 
571 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  32.35 
 
 
641 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.27 
 
 
571 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 
626 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.68 
 
 
618 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  32.53 
 
 
672 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  32.04 
 
 
613 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  27.24 
 
 
627 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.33 
 
 
669 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.83 
 
 
606 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.11 
 
 
575 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  26.36 
 
 
625 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.43 
 
 
636 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.51 
 
 
618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.1 
 
 
571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.55 
 
 
589 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  26.51 
 
 
618 aa  234  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  27.59 
 
 
594 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.7 
 
 
627 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  27.65 
 
 
600 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.91 
 
 
614 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  25.92 
 
 
628 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  30.33 
 
 
614 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  29.08 
 
 
671 aa  230  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  29.71 
 
 
637 aa  231  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26 
 
 
595 aa  231  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  31.82 
 
 
636 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  28.09 
 
 
623 aa  230  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  30.48 
 
 
601 aa  230  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
620 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
632 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  33.06 
 
 
632 aa  229  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  31.92 
 
 
634 aa  229  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.39 
 
 
618 aa  229  9e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.96 
 
 
617 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  31.28 
 
 
615 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  31.43 
 
 
665 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  32.3 
 
 
733 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.76 
 
 
615 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.89 
 
 
598 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.63 
 
 
637 aa  228  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  30.76 
 
 
596 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.52 
 
 
598 aa  227  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  31.7 
 
 
608 aa  227  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  27.97 
 
 
628 aa  227  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.2 
 
 
567 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>