More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3026 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  100 
 
 		 610 aa  1174    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  61.8 
 
 		 628 aa  611  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  46.74 
 
 		 595 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  43.6 
 
 		 608 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  43.37 
 
 		 668 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.71 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  40 
 
 		 574 aa  353  5e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.98 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  40.68 
 
 		 611 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 609 aa  343  4e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  39.29 
 
 		 595 aa  339  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 577 aa  337  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  40.92 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  36.27 
 
 		 577 aa  318  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.88 
 
 		 580 aa  313  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  40.21 
 
 		 579 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.84 
 
 		 601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  41.6 
 
 		 666 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  38.47 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  40.93 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 646 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.57 
 
 		 610 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.39 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.39 
 
 		 610 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.28 
 
 		 581 aa  240  4e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.18 
 
 		 625 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  36.32 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  30.84 
 
 		 614 aa  227  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.1 
 
 		 575 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  29.92 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.37 
 
 		 605 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  31.63 
 
 		 619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  30.7 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.94 
 
 		 632 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.01 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.35 
 
 		 614 aa  216  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  26.91 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  30.55 
 
 		 658 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  33.07 
 
 		 615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  33.05 
 
 		 642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  34.85 
 
 		 648 aa  214  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 606 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  35.19 
 
 		 607 aa  213  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  27.41 
 
 		 587 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 598 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.8 
 
 		 606 aa  212  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  26.99 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  26.99 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.84 
 
 		 1257 aa  212  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  31.49 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 596 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.27 
 
 		 615 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 		 608 aa  211  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.8 
 
 		 606 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  30.44 
 
 		 606 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  31.74 
 
 		 654 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.97 
 
 		 1194 aa  209  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  26.25 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  24.28 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.99 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  27.49 
 
 		 764 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  32.1 
 
 		 581 aa  209  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.23 
 
 		 601 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.88 
 
 		 601 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.16 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.53 
 
 		 908 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.11 
 
 		 1284 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  24.96 
 
 		 618 aa  207  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  29.01 
 
 		 603 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  27.98 
 
 		 587 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.98 
 
 		 587 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.98 
 
 		 587 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 587 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  31.09 
 
 		 637 aa  206  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  34.67 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  28.9 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  30.19 
 
 		 610 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.31 
 
 		 622 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.72 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.77 
 
 		 587 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.98 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 640 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  31.5 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 1000 aa  205  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.57 
 
 		 1024 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.44 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.42 
 
 		 607 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  31.31 
 
 		 567 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  31.69 
 
 		 628 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  27.27 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.37 
 
 		 614 aa  205  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.02 
 
 		 660 aa  205  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  27.23 
 
 		 587 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>