More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1594 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  100 
 
 		 601 aa  1148    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  46.39 
 
 		 668 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  47.19 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  46.75 
 
 		 595 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.2 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  49.53 
 
 		 666 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  46.72 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  47.19 
 
 		 628 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  42.01 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  39.89 
 
 		 577 aa  354  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.02 
 
 		 626 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 579 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 609 aa  337  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 581 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  36.67 
 
 		 595 aa  326  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  41.1 
 
 		 581 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.01 
 
 		 580 aa  317  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 581 aa  316  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  39.45 
 
 		 611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.26 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  41.7 
 
 		 590 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  41.18 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.61 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.05 
 
 		 634 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 598 aa  263  6.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 632 aa  260  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 622 aa  259  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 615 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.61 
 
 		 614 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  34.55 
 
 		 687 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  37.23 
 
 		 646 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 640 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 628 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.23 
 
 		 627 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  34.41 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  34.21 
 
 		 610 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  34.21 
 
 		 610 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.17 
 
 		 607 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  35.26 
 
 		 635 aa  246  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.75 
 
 		 619 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  33.56 
 
 		 641 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.9 
 
 		 636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  34.05 
 
 		 606 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  36.6 
 
 		 634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  35.73 
 
 		 642 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  34.19 
 
 		 632 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 596 aa  243  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  31.81 
 
 		 651 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  34.3 
 
 		 658 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.1 
 
 		 617 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  30.29 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.35 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 614 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.99 
 
 		 614 aa  239  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  33.5 
 
 		 658 aa  239  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  33.9 
 
 		 648 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  31.8 
 
 		 608 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.14 
 
 		 610 aa  236  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  35.74 
 
 		 615 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.22 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  34.25 
 
 		 652 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.06 
 
 		 631 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 640 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  35.61 
 
 		 620 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  32.42 
 
 		 608 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.68 
 
 		 597 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  27.4 
 
 		 617 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.68 
 
 		 597 aa  233  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  34.45 
 
 		 637 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  36.67 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 1218 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  31.06 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 1000 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.09 
 
 		 654 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  27.4 
 
 		 620 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  34.37 
 
 		 637 aa  232  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  35 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.8 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.56 
 
 		 608 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.45 
 
 		 622 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 642 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  32.6 
 
 		 620 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.74 
 
 		 627 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.25 
 
 		 621 aa  230  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  33.62 
 
 		 605 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.26 
 
 		 1257 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  33.5 
 
 		 593 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  31.89 
 
 		 645 aa  229  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.26 
 
 		 618 aa  229  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  33.09 
 
 		 629 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  33.71 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 622 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  32.61 
 
 		 626 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  31.95 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  34.75 
 
 		 602 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.33 
 
 		 627 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>