More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3726 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1108    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  49.65 
 
 
577 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
579 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
577 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.63 
 
 
580 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  45.99 
 
 
595 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  48.71 
 
 
601 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
581 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
581 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  46.02 
 
 
590 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
579 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  43.38 
 
 
611 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  44.35 
 
 
581 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
646 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  42.56 
 
 
579 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38 
 
 
581 aa  309  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  38.69 
 
 
608 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.73 
 
 
668 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  37.72 
 
 
609 aa  263  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
601 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.42 
 
 
610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.44 
 
 
626 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  36.44 
 
 
574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  38.55 
 
 
578 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  38.4 
 
 
595 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.8 
 
 
610 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.8 
 
 
610 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.8 
 
 
610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.47 
 
 
598 aa  244  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.69 
 
 
607 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.65 
 
 
597 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.47 
 
 
597 aa  240  4e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  27.77 
 
 
617 aa  238  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  27.94 
 
 
587 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  33.74 
 
 
601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.65 
 
 
587 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  37.97 
 
 
628 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.11 
 
 
587 aa  234  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
614 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.19 
 
 
575 aa  230  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  36.08 
 
 
610 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
628 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
632 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.55 
 
 
587 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.55 
 
 
587 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 
587 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 
587 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.55 
 
 
587 aa  228  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  26.05 
 
 
597 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.4 
 
 
587 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34.33 
 
 
606 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.41 
 
 
1301 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.4 
 
 
608 aa  224  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.22 
 
 
587 aa  224  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  28.29 
 
 
620 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.67 
 
 
622 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.88 
 
 
634 aa  223  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.83 
 
 
605 aa  223  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  29.12 
 
 
587 aa  223  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  32.76 
 
 
634 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  27.19 
 
 
618 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  25.65 
 
 
625 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  27.5 
 
 
575 aa  220  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.6 
 
 
637 aa  220  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.94 
 
 
618 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  32.6 
 
 
606 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  32.22 
 
 
585 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  27.13 
 
 
636 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  30.18 
 
 
594 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  31.41 
 
 
614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.2 
 
 
1257 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.97 
 
 
609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  27.7 
 
 
589 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  26.15 
 
 
588 aa  217  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  25.99 
 
 
566 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.06 
 
 
597 aa  217  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.62 
 
 
637 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.03 
 
 
609 aa  216  7e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  30.03 
 
 
613 aa  216  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.52 
 
 
600 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  34.16 
 
 
615 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.52 
 
 
606 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.32 
 
 
597 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  30.18 
 
 
636 aa  216  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.98 
 
 
587 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.28 
 
 
598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.89 
 
 
631 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.78 
 
 
582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  25.35 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.81 
 
 
566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.09 
 
 
571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.63 
 
 
614 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  30.99 
 
 
608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  25.51 
 
 
628 aa  214  2.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  32.5 
 
 
648 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.6 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.26 
 
 
571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.26 
 
 
571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.26 
 
 
571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 
663 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>